More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1934 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  323  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  100 
 
 
154 aa  323  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  100 
 
 
154 aa  323  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  100 
 
 
154 aa  323  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  98.7 
 
 
154 aa  321  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  98.7 
 
 
154 aa  321  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  98.7 
 
 
154 aa  321  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  98.7 
 
 
154 aa  320  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  98.05 
 
 
154 aa  319  9e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  86.36 
 
 
154 aa  288  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  86.36 
 
 
154 aa  288  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  86.36 
 
 
154 aa  288  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  86.36 
 
 
154 aa  288  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  86.36 
 
 
154 aa  288  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  81.82 
 
 
154 aa  272  1e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  69.13 
 
 
154 aa  231  2e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  68.63 
 
 
154 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  68.63 
 
 
154 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  66.67 
 
 
157 aa  223  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  70.14 
 
 
143 aa  222  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  66.03 
 
 
162 aa  220  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  62.82 
 
 
154 aa  213  1e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  65.77 
 
 
155 aa  212  2e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  49.61 
 
 
156 aa  136  9e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  42.95 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  42.95 
 
 
159 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56196e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  42.95 
 
 
159 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  4.1841e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  42.95 
 
 
159 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
164 aa  132  2e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
154 aa  132  2e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  42.77 
 
 
154 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  43.31 
 
 
162 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  43.75 
 
 
162 aa  130  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  48.03 
 
 
188 aa  130  8e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
150 aa  129  2e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  49.19 
 
 
191 aa  129  2e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  49.19 
 
 
191 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  48.39 
 
 
190 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  48.39 
 
 
190 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  48.39 
 
 
190 aa  127  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.18421e-09 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  41.36 
 
 
167 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  48.39 
 
 
147 aa  127  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.10623e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  48.39 
 
 
147 aa  127  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.43067e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  43.62 
 
 
148 aa  126  1e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  46.27 
 
 
189 aa  126  1e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  47.83 
 
 
183 aa  126  1e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  48.39 
 
 
189 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  41.29 
 
 
166 aa  124  4e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  50.43 
 
 
205 aa  124  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  43.57 
 
 
171 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  44.35 
 
 
194 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  46.46 
 
 
193 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  44.35 
 
 
194 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  44.35 
 
 
172 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  45.67 
 
 
194 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  47.58 
 
 
191 aa  121  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  41.84 
 
 
164 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  41.84 
 
 
164 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  47.06 
 
 
179 aa  117  8e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  50 
 
 
196 aa  116  1e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.56339e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  50 
 
 
171 aa  112  2e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  40.28 
 
 
152 aa  111  4e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  40 
 
 
153 aa  110  7e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  39.07 
 
 
333 aa  108  2e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  46.61 
 
 
214 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  42.19 
 
 
188 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
191 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  50.46 
 
 
150 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  41.6 
 
 
211 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  40 
 
 
240 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  36.54 
 
 
159 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  41.59 
 
 
231 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
302 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  48.15 
 
 
205 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  31.72 
 
 
186 aa  100  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.66 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  41.03 
 
 
221 aa  99.8  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
207 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  31.36 
 
 
195 aa  99  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
193 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  39.37 
 
 
207 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  38.89 
 
 
209 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.55 
 
 
217 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  34.46 
 
 
173 aa  98.2  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
208 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0595  NLP/P60 protein  40.8 
 
 
201 aa  97.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  45.61 
 
 
209 aa  97.8  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  35.58 
 
 
181 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
184 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  42.34 
 
 
205 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  4.4472e-09 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  32.39 
 
 
193 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4708  NLP/P60 protein  40.71 
 
 
214 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341111  normal  0.0906731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>