153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1908 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  99.33 
 
 		 450 aa  924    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 		 450 aa  929    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  90.18 
 
 		 451 aa  842    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  99.33 
 
 		 450 aa  924    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  99.11 
 
 		 450 aa  921    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  98.89 
 
 		 450 aa  919    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  99.11 
 
 		 450 aa  922    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  98.44 
 
 		 450 aa  915    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  90.44 
 
 		 451 aa  854    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  90.22 
 
 		 451 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  90.89 
 
 		 451 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  90.67 
 
 		 451 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  90.44 
 
 		 451 aa  854    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  98.67 
 
 		 450 aa  918    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  53.3 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  52.18 
 
 		 441 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 		 441 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  51.72 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  52.18 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  51.95 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  51.72 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  51.72 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  46.77 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  48.07 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  47.38 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  44.87 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  44.83 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  43.05 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  43.25 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  42.99 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  44.06 
 
 		 435 aa  352  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  43.18 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  43.18 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  42.24 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  38.24 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  38.13 
 
 		 424 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  38.14 
 
 		 416 aa  273  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  34.87 
 
 		 419 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  32.49 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  33.94 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  33.03 
 
 		 415 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  31.12 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  30.79 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  29.59 
 
 		 410 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  29.61 
 
 		 453 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  28.73 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  30.44 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  28.37 
 
 		 485 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  29.44 
 
 		 447 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  27.43 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  27.17 
 
 		 442 aa  169  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  29.07 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 		 461 aa  167  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0536804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  27.05 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  27.05 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.05 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.05 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.61 
 
 		 440 aa  163  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  26.64 
 
 		 459 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  26.21 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  26.23 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.59 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  28.41 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.82 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  27.8 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  25.49 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  27.48 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  26.22 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  26.56 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  25.5 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  27.17 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  26.87 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  26.72 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  26.3 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  25.65 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  25.65 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  25.65 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  25.65 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  25.65 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  25.65 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  25.65 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  25.65 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  26.3 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.61 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  25.22 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  24.78 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  24.78 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  24.78 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  24.78 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>