More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1878 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  99.71 
 
 
347 aa  706  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  99.42 
 
 
347 aa  704  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.90113e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  92.8 
 
 
347 aa  664  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  92.51 
 
 
347 aa  663  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  92.8 
 
 
347 aa  664  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  99.42 
 
 
347 aa  704  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  99.71 
 
 
347 aa  706  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  93.08 
 
 
347 aa  665  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  7.66912e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  92.8 
 
 
347 aa  664  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  99.71 
 
 
347 aa  706  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  5.20996e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  99.71 
 
 
347 aa  706  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  100 
 
 
347 aa  708  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  90.78 
 
 
347 aa  648  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  100 
 
 
347 aa  708  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.47238e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  99.42 
 
 
347 aa  705  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  76.01 
 
 
348 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.96401e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  76.01 
 
 
348 aa  551  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  75.43 
 
 
348 aa  547  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.22806e-06  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  76.59 
 
 
347 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  64.83 
 
 
351 aa  470  1e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  66.27 
 
 
344 aa  465  1e-130  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  68.18 
 
 
344 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  65.57 
 
 
344 aa  458  1e-128  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  65.07 
 
 
344 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  64.78 
 
 
344 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  65.5 
 
 
347 aa  452  1e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0696  selenophosphate synthetase  67.58 
 
 
344 aa  451  1e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  66.57 
 
 
344 aa  452  1e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  65.37 
 
 
344 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  65.97 
 
 
344 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  61.68 
 
 
346 aa  441  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  64.18 
 
 
345 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  62.14 
 
 
347 aa  438  1e-122  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  59.14 
 
 
359 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.99112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  61.27 
 
 
347 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3755  selenophosphate synthetase  64.24 
 
 
344 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373103  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  64.74 
 
 
352 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  61.79 
 
 
346 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  63.66 
 
 
344 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  61.98 
 
 
351 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  63.06 
 
 
352 aa  428  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  62.73 
 
 
352 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  62.73 
 
 
352 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  62.42 
 
 
352 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  61.86 
 
 
352 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  61.38 
 
 
351 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  62.42 
 
 
352 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  58.77 
 
 
362 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  62.01 
 
 
352 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  61.56 
 
 
352 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  65.12 
 
 
352 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  58.86 
 
 
343 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3011  selenide, water dikinase  58.67 
 
 
359 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  57.27 
 
 
345 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  58.11 
 
 
353 aa  401  1e-110  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1621  selenophosphate synthetase  61.22 
 
 
361 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  56.85 
 
 
351 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  53.15 
 
 
356 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  53.15 
 
 
354 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  53.15 
 
 
354 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  52.54 
 
 
385 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  52.54 
 
 
421 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  52.85 
 
 
356 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  52.37 
 
 
389 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  52.07 
 
 
354 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  52.07 
 
 
357 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  52.07 
 
 
357 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  51.78 
 
 
357 aa  328  1e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  51.48 
 
 
354 aa  327  2e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  51.48 
 
 
357 aa  327  2e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  51.78 
 
 
357 aa  327  2e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  50.45 
 
 
346 aa  325  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  48.52 
 
 
348 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 
354 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  51.48 
 
 
357 aa  321  1e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  50.29 
 
 
358 aa  321  1e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  51.62 
 
 
353 aa  321  1e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  51.72 
 
 
355 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  49.57 
 
 
355 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.66487e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  50.3 
 
 
671 aa  316  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  49.55 
 
 
389 aa  315  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  49.42 
 
 
357 aa  315  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  51.69 
 
 
360 aa  314  2e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  50 
 
 
359 aa  313  3e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  49.71 
 
 
350 aa  313  4e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  47.83 
 
 
356 aa  312  5e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  48.35 
 
 
357 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  50.16 
 
 
354 aa  310  3e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  47.25 
 
 
356 aa  309  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  49.42 
 
 
369 aa  308  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  50.97 
 
 
350 aa  303  3e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  46.71 
 
 
359 aa  302  5e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  48.73 
 
 
353 aa  298  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  51.52 
 
 
347 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  49.85 
 
 
351 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  46.45 
 
 
348 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  48.3 
 
 
348 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  49.54 
 
 
351 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  49.7 
 
 
351 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  48.23 
 
 
349 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>