70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1749 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01862  DNA-binding transcriptional dual regulator with FlhD  100 
 
 
192 aa  398  1e-110  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120184  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2124  transcriptional activator FlhC  100 
 
 
192 aa  398  1e-110  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.19739e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1987  transcriptional activator FlhC  100 
 
 
192 aa  398  1e-110  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.76515e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1741  transcriptional activator FlhC  100 
 
 
192 aa  398  1e-110  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0165294  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1293  transcriptional activator FlhC  100 
 
 
192 aa  398  1e-110  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.69598e-08  decreased coverage  6.43464e-09 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2630  transcriptional activator FlhC  100 
 
 
192 aa  398  1e-110  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.74971e-07  hitchhiker  2.52047e-15 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01851  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  398  1e-110  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1749  flagellar transcriptional activator FlhC  100 
 
 
192 aa  398  1e-110  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0010889  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1197  transcriptional activator FlhC  93.75 
 
 
194 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  7.25096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2085  transcriptional activator FlhC  93.75 
 
 
194 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00157858  unclonable  1.91198e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2140  transcriptional activator FlhC  93.75 
 
 
192 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000606763  unclonable  4.37238e-33 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1320  transcriptional activator FlhC  93.75 
 
 
192 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.70782e-05  decreased coverage  3.16651e-27 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2080  transcriptional activator FlhC  93.75 
 
 
192 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  3.48809e-06  decreased coverage  4.27944e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2469  transcriptional activator FlhC  92.71 
 
 
192 aa  367  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.43511e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1852  transcriptional activator FlhC  83.85 
 
 
192 aa  338  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00303286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2988  transcriptional activator FlhC  84.46 
 
 
193 aa  338  3e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.996074  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2614  transcriptional activator FlhC  83.33 
 
 
192 aa  337  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00253226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1537  transcriptional activator FlhC  82.81 
 
 
193 aa  330  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00505633  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2828  transcriptional activator FlhC  82.38 
 
 
193 aa  328  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.896051  normal  0.0881752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1635  transcriptional activator FlhC  82.38 
 
 
193 aa  328  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1746  transcriptional activator FlhC  82.38 
 
 
193 aa  328  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0285133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1509  transcriptional activator FlhC  81.77 
 
 
193 aa  327  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0026614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3686  transcriptional activator FlhC  61.36 
 
 
201 aa  234  5e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3859  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
183 aa  233  2e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1680  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
183 aa  233  2e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.840947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3940  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
183 aa  233  2e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3439  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
183 aa  233  2e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0081  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
183 aa  233  2e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2863  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
183 aa  233  2e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5605  transcriptional activator FlhC  61.24 
 
 
201 aa  233  2e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.31133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3112  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
183 aa  233  2e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2027  transcriptional activator FlhC  60.44 
 
 
203 aa  231  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000461125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3186  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
183 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124495  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0115  transcriptional activator FlhC  58.76 
 
 
186 aa  230  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533047  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0161  transcriptional activator FlhC  60.82 
 
 
198 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0234  transcriptional activator FlhC  60.23 
 
 
184 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2978  transcriptional activator FlhC  59.06 
 
 
203 aa  228  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0708e-08 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2855  transcriptional activator FlhC  60.23 
 
 
184 aa  227  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.382848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0252  transcriptional activator FlhC  60.23 
 
 
184 aa  227  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3819  transcriptional activator FlhC  57.63 
 
 
186 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0178  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
184 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0165  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
184 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3354  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
184 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1306  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
181 aa  224  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24310  transcriptional activator FlhC  59.65 
 
 
193 aa  219  2e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3228  transcriptional activator FlhC  50.28 
 
 
195 aa  214  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20368  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1942  transcriptional activator FlhC  53.41 
 
 
182 aa  210  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0152  transcriptional activator FlhC  54.12 
 
 
178 aa  201  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1004  transcriptional activator FlhC  53.53 
 
 
178 aa  200  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2870  transcriptional activator FlhC  54.71 
 
 
178 aa  200  1e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4159  transcriptional activator FlhC  54.12 
 
 
202 aa  198  4e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1241  transcriptional activator FlhC  54.39 
 
 
184 aa  197  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4638  transcriptional activator FlhC  52.73 
 
 
207 aa  196  2e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0578695  normal  0.560495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7082  transcriptional activator FlhC  50.53 
 
 
219 aa  196  2e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4543  transcriptional activator FlhC  52.12 
 
 
189 aa  195  4e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278066  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0857  transcriptional activator FlhC  52.12 
 
 
189 aa  195  4e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563852  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1412  transcriptional activator FlhC  47.03 
 
 
186 aa  194  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.567271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4156  transcriptional activator FlhC  48.35 
 
 
186 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4044  transcriptional activator FlhC  48.35 
 
 
186 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3701  transcriptional activator FlhC  51.5 
 
 
181 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1691  transcriptional activator FlhC  47.31 
 
 
213 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2005  transcriptional activator FlhC  50.9 
 
 
183 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0232407  hitchhiker  0.00239216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4210  transcriptional activator FlhC  53.8 
 
 
210 aa  187  6e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1859  transcriptional activator FlhC  50.9 
 
 
184 aa  183  1e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2885  transcriptional activator FlhC  49.7 
 
 
179 aa  182  2e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.217892  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2372  transcriptional activator FlhC  49.1 
 
 
179 aa  180  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2235  transcriptional activator FlhC  48.5 
 
 
180 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.896316  normal  0.0400071 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7664  transcriptional activator FlhC  47.95 
 
 
225 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222653  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4738  flagellar transcriptional activator FlhC  29.45 
 
 
185 aa  56.6  2e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1551  hypothetical protein  26.6 
 
 
220 aa  50.1  2e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal  0.0855626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>