21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1696 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1696  conserved hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2729  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000173334  normal  0.499311 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2052  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2185  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1690  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611626  hitchhiker  0.00184343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1232  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334159  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1075  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000779969  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1258  hypothetical protein  98.39 
 
 
65 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00498936  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1136  hypothetical protein  98.39 
 
 
65 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000307379  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2142  hypothetical protein  98.39 
 
 
65 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000250627  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2146  hypothetical protein  98.39 
 
 
64 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00313167  hitchhiker  0.00464128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2200  hypothetical protein  98.39 
 
 
64 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.753723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2543  hypothetical protein  91.94 
 
 
62 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000198057  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2833  hypothetical protein  83.05 
 
 
63 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0649641  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1630  hypothetical protein  83.05 
 
 
63 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1741  hypothetical protein  82.76 
 
 
63 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2618  hypothetical protein  72.88 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1848  hypothetical protein  74.58 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.768315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3051  hypothetical protein  72.88 
 
 
71 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1506  hypothetical protein  71.19 
 
 
63 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425552  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1534  hypothetical protein  67.8 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.898397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>