More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1690 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  99.67 
 
 		 306 aa  584  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  99.67 
 
 		 306 aa  584  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  87.58 
 
 		 306 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  87.91 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  87.91 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  87.91 
 
 		 306 aa  500  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  87.91 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  85.76 
 
 		 304 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  67.24 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  67.24 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  66.9 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  68.92 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  60.36 
 
 		 296 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  55.63 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  58.82 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  55.36 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  56.45 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  55.02 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  55.1 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  56.1 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.91 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.12 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  45.39 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  41.99 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  40.94 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.96 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.96 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  38.81 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  37.32 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  44.09 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  38.91 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.42 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.9 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  37.04 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  40.38 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  39.69 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.86 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  39.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  39.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.15 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  39.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  39.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  39.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  39.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  39.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  38.13 
 
 		 494 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.59 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  37.36 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  36.88 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  37.35 
 
 		 414 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.88 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  38.13 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  38.13 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  40.16 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  38.13 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  37.74 
 
 		 392 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  36.49 
 
 		 392 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  38.89 
 
 		 519 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  35.71 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02859  integral membrane protein  42.68 
 
 		 159 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  32.73 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  29.01 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.14 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  32.21 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.19 
 
 		 348 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.88 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  28.77 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  29.39 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  30.53 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  31.39 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  28.97 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  29.23 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  29.81 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  29.81 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  29.81 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  29.66 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  31.82 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  28.08 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  27.69 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  28.9 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  27.89 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  27.11 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  27.57 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  28.57 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>