89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1645 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  97.33 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  97.33 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  97.33 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  97.33 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  97.33 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  97.33 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  97.33 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  97.33 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  58.67 
 
 		 76 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  63.01 
 
 		 74 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  63.01 
 
 		 74 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1499  hypothetical protein  58.11 
 
 		 74 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  52 
 
 		 76 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  54.67 
 
 		 75 aa  94.4  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  55.41 
 
 		 75 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  59.42 
 
 		 73 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  34.78 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  34.72 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  34.72 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  33.33 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  27.14 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  34.78 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  36.23 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  37.68 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  25.68 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  34.78 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  29.17 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.71 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  30 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  32.86 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  35 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  22.22 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  35.85 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  32.79 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  33.87 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  25.71 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  30.88 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  31.67 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  32.35 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  30.43 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  32.79 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  27.54 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  26.76 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  33.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  32.26 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  28.57 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  26.39 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  29.17 
 
 		 77 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  30.43 
 
 		 75 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  30 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  28.07 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  28.07 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  28.07 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  24.66 
 
 		 82 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  28.07 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  31.43 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  34.43 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  32 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  31.43 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  31.43 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  31.43 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  35.09 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  30 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  30 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  30 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  32.2 
 
 		 75 aa  40  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  28.33 
 
 		 78 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>