More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1628 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.28 
 
 
471 aa  698  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  87.39 
 
 
469 aa  850  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  87.61 
 
 
469 aa  852  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  98.93 
 
 
468 aa  951  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  98.72 
 
 
468 aa  949  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.35 
 
 
470 aa  696  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.07 
 
 
470 aa  683  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.93 
 
 
469 aa  724  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  99.36 
 
 
468 aa  953  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.29 
 
 
469 aa  696  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  96.58 
 
 
468 aa  929  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  96.58 
 
 
468 aa  930  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  96.58 
 
 
468 aa  929  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.92 
 
 
471 aa  704  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  96.79 
 
 
468 aa  930  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  96.58 
 
 
468 aa  929  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  99.57 
 
 
468 aa  954  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50075e-05 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0397  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  73.08 
 
 
468 aa  724  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.92 
 
 
470 aa  691  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.28 
 
 
471 aa  698  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.28 
 
 
471 aa  698  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.35 
 
 
470 aa  696  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  95.51 
 
 
468 aa  922  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  65.75 
 
 
475 aa  650  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.1 
 
 
468 aa  657  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  66.17 
 
 
478 aa  645  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.32976e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  68.8 
 
 
472 aa  665  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.28 
 
 
470 aa  686  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.1 
 
 
468 aa  657  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  87.61 
 
 
469 aa  852  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  95.94 
 
 
468 aa  926  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  99.57 
 
 
468 aa  954  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.28 
 
 
471 aa  698  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  88.49 
 
 
468 aa  856  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.35 
 
 
470 aa  696  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.5 
 
 
469 aa  719  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.28 
 
 
471 aa  698  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  88.7 
 
 
468 aa  851  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.28 
 
 
471 aa  708  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  100 
 
 
468 aa  957  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  99.15 
 
 
468 aa  951  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.71 
 
 
470 aa  691  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  99.15 
 
 
468 aa  951  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  87.42 
 
 
468 aa  845  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  87.42 
 
 
468 aa  846  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  86.78 
 
 
468 aa  837  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.28 
 
 
471 aa  698  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  71 
 
 
469 aa  696  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  64.48 
 
 
477 aa  636  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.23 
 
 
469 aa  632  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.23 
 
 
469 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.23 
 
 
469 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.23 
 
 
469 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.23 
 
 
469 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.23 
 
 
469 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  62.9 
 
 
477 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1071  6-phosphogluconate dehydrogenase  66.02 
 
 
468 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2765  6-phosphogluconate dehydrogenase  63.42 
 
 
468 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2810  6-phosphogluconate dehydrogenase  63.42 
 
 
468 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.24 
 
 
482 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1275  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  57.66 
 
 
476 aa  555  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.374225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2527  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.66 
 
 
476 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.585801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1834  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.96 
 
 
473 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.96 
 
 
473 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.96 
 
 
473 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.84 
 
 
471 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.08 
 
 
489 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.15 
 
 
475 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.68 
 
 
484 aa  538  1e-152  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  56.2 
 
 
490 aa  540  1e-152  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.41 
 
 
484 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16410  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  55.98 
 
 
479 aa  529  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.23 
 
 
484 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  55.98 
 
 
474 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.31 
 
 
485 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  55.16 
 
 
483 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.51 
 
 
501 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0180  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.55 
 
 
484 aa  524  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  55.56 
 
 
482 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1948  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.74 
 
 
481 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11872  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.88 
 
 
483 aa  518  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.87104e-06  normal  0.308881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.66 
 
 
490 aa  520  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3824  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.56 
 
 
478 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.75231  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0339  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.49 
 
 
482 aa  515  1e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00114124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3598  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.09 
 
 
486 aa  516  1e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.98 
 
 
482 aa  515  1e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1596  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.06 
 
 
480 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.963991  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.7 
 
 
482 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1889  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.76 
 
 
483 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0324159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2762  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.32 
 
 
485 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.69 
 
 
484 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3445  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.1 
 
 
478 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  0.0734674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3959  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.6 
 
 
476 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4301  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.98 
 
 
480 aa  508  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02427  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.27 
 
 
482 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1244  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.67 
 
 
484 aa  505  1e-142  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.91 
 
 
523 aa  507  1e-142  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2102  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 
479 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.157506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3359  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.36 
 
 
484 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2816  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.56 
 
 
475 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0492392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>