99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1593 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  98.87 
 
 
617 aa  1244  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  76.05 
 
 
618 aa  987  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  76.05 
 
 
618 aa  989  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  76.05 
 
 
618 aa  987  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  99.84 
 
 
617 aa  1254  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  99.84 
 
 
617 aa  1255  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  100 
 
 
617 aa  1255  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  100 
 
 
617 aa  1255  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  98.22 
 
 
617 aa  1234  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  67.75 
 
 
615 aa  879  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  76.05 
 
 
618 aa  987  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  76.21 
 
 
618 aa  990  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.45795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  100 
 
 
617 aa  1255  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  99.51 
 
 
617 aa  1248  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  98.87 
 
 
617 aa  1244  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  48.55 
 
 
611 aa  584  1e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  47.82 
 
 
611 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  46.08 
 
 
618 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  47.5 
 
 
611 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  46.08 
 
 
618 aa  555  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  46.08 
 
 
618 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  43.16 
 
 
599 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  44.19 
 
 
604 aa  508  1e-142  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.25 
 
 
606 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.84 
 
 
606 aa  155  3e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  24.66 
 
 
606 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25 
 
 
606 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  24.49 
 
 
606 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  23.29 
 
 
607 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  23.86 
 
 
614 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  23.54 
 
 
607 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  22.93 
 
 
607 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  23.54 
 
 
604 aa  136  1e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.73 
 
 
607 aa  135  2e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.46 
 
 
612 aa  132  2e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  25.13 
 
 
695 aa  129  1e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  23.81 
 
 
608 aa  129  1e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.0206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  21.95 
 
 
614 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  21.77 
 
 
611 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  21.56 
 
 
606 aa  123  1e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  26.47 
 
 
695 aa  122  2e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  24.03 
 
 
699 aa  118  4e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.46 
 
 
719 aa  110  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  23.5 
 
 
703 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  21.74 
 
 
696 aa  100  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  24.58 
 
 
742 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  23.41 
 
 
712 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.51 
 
 
812 aa  90.9  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.77 
 
 
640 aa  87  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  22.95 
 
 
732 aa  78.6  3e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  22.77 
 
 
797 aa  74.7  4e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  20.49 
 
 
741 aa  71.6  4e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  4.75178e-08 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  22.51 
 
 
826 aa  70.9  7e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  21.08 
 
 
602 aa  70.5  9e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  21.2 
 
 
893 aa  70.1  1e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  21.17 
 
 
794 aa  69.7  1e-10  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  21.61 
 
 
682 aa  68.9  3e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  20.64 
 
 
789 aa  67.4  7e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  21.22 
 
 
649 aa  65.5  2e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  20.68 
 
 
745 aa  63.5  9e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  19.15 
 
 
762 aa  63.5  1e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  23.57 
 
 
649 aa  60.5  8e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  21.12 
 
 
747 aa  60.5  9e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  20.51 
 
 
725 aa  60.5  9e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  22.35 
 
 
506 aa  60.1  1e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  21.24 
 
 
740 aa  59.7  1e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  20.23 
 
 
711 aa  59.7  2e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  20.21 
 
 
709 aa  58.5  3e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  23.05 
 
 
705 aa  58.5  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  20.58 
 
 
655 aa  57.8  6e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  21.33 
 
 
748 aa  55.8  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  20.89 
 
 
1013 aa  55.1  3e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  21.27 
 
 
741 aa  55.1  4e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  21.71 
 
 
748 aa  54.7  5e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  21.54 
 
 
748 aa  54.3  6e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  20.67 
 
 
748 aa  53.9  8e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  21.09 
 
 
646 aa  53.9  9e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  20.41 
 
 
634 aa  52.4  3e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  17.81 
 
 
750 aa  52  3e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  21.24 
 
 
704 aa  51.6  4e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  28.89 
 
 
640 aa  51.2  5e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  18.42 
 
 
701 aa  50.8  7e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  19.84 
 
 
599 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  18.34 
 
 
741 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.56 
 
 
1077 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  20.08 
 
 
611 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  19.38 
 
 
1094 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  22.2 
 
 
649 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  29.41 
 
 
508 aa  47.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  29.41 
 
 
502 aa  48.1  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  22.65 
 
 
609 aa  48.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  17.81 
 
 
750 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  27.12 
 
 
675 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  22.67 
 
 
660 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  22.67 
 
 
660 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  29.21 
 
 
741 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  19.12 
 
 
677 aa  45.8  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  21.73 
 
 
649 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.91 
 
 
645 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>