More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1561 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
284 aa  590  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  100 
 
 
284 aa  590  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
284 aa  590  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  99.65 
 
 
284 aa  589  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  99.65 
 
 
284 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  99.3 
 
 
284 aa  587  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  99.65 
 
 
284 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  98.94 
 
 
284 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  98.24 
 
 
284 aa  583  1e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  68.55 
 
 
330 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  68.55 
 
 
330 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  68.55 
 
 
284 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  68.2 
 
 
330 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  68.55 
 
 
330 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  63.96 
 
 
284 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  60.99 
 
 
284 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  58.3 
 
 
284 aa  357  1e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  58.3 
 
 
284 aa  356  2e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  58.3 
 
 
284 aa  356  2e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  58.72 
 
 
283 aa  351  6e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  55.91 
 
 
292 aa  337  1e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  54.77 
 
 
286 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  54.77 
 
 
286 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  54.77 
 
 
286 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  54.77 
 
 
286 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  54.77 
 
 
286 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  54.77 
 
 
286 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  54.77 
 
 
286 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  54.42 
 
 
286 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  54.48 
 
 
292 aa  330  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  56.94 
 
 
281 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  56.94 
 
 
281 aa  328  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  55.32 
 
 
285 aa  327  1e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  54.96 
 
 
285 aa  325  4e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  47.16 
 
 
283 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.01 
 
 
284 aa  270  3e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.31 
 
 
284 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.04 
 
 
283 aa  261  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  48.94 
 
 
284 aa  260  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.01 
 
 
284 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  42.4 
 
 
284 aa  254  1e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.27011e-05  hitchhiker  7.97391e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.96 
 
 
284 aa  252  5e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.76 
 
 
286 aa  248  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.46 
 
 
288 aa  241  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 
284 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  41.81 
 
 
285 aa  233  2e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  41.81 
 
 
285 aa  233  2e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.38483e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  41.81 
 
 
285 aa  233  2e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.94647e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  42.16 
 
 
285 aa  233  2e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  41.81 
 
 
285 aa  233  2e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.64685e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  41.81 
 
 
285 aa  233  2e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  41.81 
 
 
285 aa  234  2e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  41.81 
 
 
285 aa  233  2e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.25466e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  41.81 
 
 
285 aa  233  2e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.43751e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  41.46 
 
 
285 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.30479e-05  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  42.7 
 
 
283 aa  232  6e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  41.46 
 
 
285 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.44747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  42.16 
 
 
286 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  42.16 
 
 
286 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  40.39 
 
 
316 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.23 
 
 
311 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  9.08669e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.14 
 
 
307 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  41.53 
 
 
307 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  41.84 
 
 
283 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  38.51 
 
 
309 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.91041e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  41.11 
 
 
286 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  41.79 
 
 
295 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.87 
 
 
323 aa  222  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.56456e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.9 
 
 
287 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
287 aa  220  2e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.22 
 
 
330 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  39.72 
 
 
287 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.54 
 
 
311 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.39 
 
 
308 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.65 
 
 
308 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.26 
 
 
312 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  36.89 
 
 
307 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.05 
 
 
309 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  36.59 
 
 
308 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1456  ketose-bisphosphate aldolase  41.4 
 
 
293 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.78 
 
 
313 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  41.2 
 
 
281 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.13 
 
 
307 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.1 
 
 
313 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.04 
 
 
307 aa  199  4e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  41.03 
 
 
281 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.36 
 
 
307 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  36.43 
 
 
281 aa  199  6e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.67 
 
 
305 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  38.95 
 
 
286 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2625  ketose-bisphosphate aldolase  38.85 
 
 
281 aa  192  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.85286e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  34.29 
 
 
324 aa  192  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  35.62 
 
 
297 aa  191  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  34.6 
 
 
324 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.81 
 
 
328 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  34.21 
 
 
327 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  34.29 
 
 
324 aa  189  6e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  38.46 
 
 
286 aa  189  6e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  38.91 
 
 
286 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  35.24 
 
 
324 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>