255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1500 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  100 
 
 
349 aa  689  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  99.71 
 
 
349 aa  684  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.79624e-06  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  689  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  689  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  689  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  99.71 
 
 
349 aa  688  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  689  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  689  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.52069e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  689  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  88.54 
 
 
349 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  88.54 
 
 
349 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  88.54 
 
 
349 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  88.54 
 
 
349 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  88.83 
 
 
349 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  84.53 
 
 
348 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  68.14 
 
 
362 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0779e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  65.88 
 
 
362 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  65.88 
 
 
362 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  65.88 
 
 
362 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  55.81 
 
 
359 aa  361  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  54.26 
 
 
355 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  57.58 
 
 
357 aa  353  3e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  55.43 
 
 
361 aa  345  7e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  56.97 
 
 
325 aa  328  7e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  53.49 
 
 
359 aa  315  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  60.64 
 
 
355 aa  305  1e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  60.75 
 
 
361 aa  304  1e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  60.28 
 
 
355 aa  302  5e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  52.41 
 
 
340 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  51.51 
 
 
411 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  52.68 
 
 
368 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  50.49 
 
 
360 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  52.84 
 
 
361 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  46.75 
 
 
348 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  54.43 
 
 
360 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  54.43 
 
 
360 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  46.02 
 
 
338 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  1.03691e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  48.31 
 
 
340 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  48.96 
 
 
365 aa  246  5e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  39.06 
 
 
346 aa  223  5e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  39.06 
 
 
361 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  39.06 
 
 
361 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  39.81 
 
 
365 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  38.12 
 
 
361 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  43.99 
 
 
361 aa  219  8e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  39.75 
 
 
358 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  45.27 
 
 
329 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  41.07 
 
 
353 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  39.44 
 
 
343 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  40.06 
 
 
353 aa  215  1e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  38.89 
 
 
365 aa  214  2e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  42.81 
 
 
362 aa  214  2e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  44.44 
 
 
336 aa  212  8e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  38.8 
 
 
356 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  38.8 
 
 
356 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  38.17 
 
 
356 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  40.45 
 
 
355 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  38.49 
 
 
356 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0264  hypothetical protein  46.56 
 
 
347 aa  209  7e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  40.13 
 
 
355 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  43.03 
 
 
342 aa  208  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  42.61 
 
 
343 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1111  hypothetical protein  42.61 
 
 
366 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00425236  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  38.29 
 
 
420 aa  205  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0954  hypothetical protein  44.58 
 
 
367 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.006029  normal  0.0131459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  45.17 
 
 
331 aa  201  2e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  39.75 
 
 
353 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  42.81 
 
 
336 aa  198  1e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1051  hypothetical protein  42.64 
 
 
367 aa  198  1e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00435413  normal  0.0767092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  40.19 
 
 
360 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  40.19 
 
 
360 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  39.8 
 
 
353 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  36.8 
 
 
365 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  36.8 
 
 
365 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  41.78 
 
 
327 aa  186  7e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  36.5 
 
 
355 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  38.11 
 
 
355 aa  179  6e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  38.38 
 
 
352 aa  172  7e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  38.31 
 
 
324 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  36.02 
 
 
339 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  36.93 
 
 
354 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  36.83 
 
 
348 aa  167  3e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  34.45 
 
 
340 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  34.45 
 
 
352 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  34.45 
 
 
340 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  34.45 
 
 
352 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  34.45 
 
 
352 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  34.15 
 
 
340 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  32.38 
 
 
331 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  32.38 
 
 
331 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  33.74 
 
 
340 aa  154  3e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  33.84 
 
 
352 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  33.84 
 
 
340 aa  152  9e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  33.23 
 
 
340 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  31.77 
 
 
328 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  31.76 
 
 
345 aa  148  1e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.96509e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  32.86 
 
 
337 aa  146  4e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.56 
 
 
335 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  34.39 
 
 
343 aa  142  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.04675e-06  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  32.42 
 
 
341 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.95194e-10  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>