124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1426 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02159  adhesin  98.62 
 
 		 1250 aa  2438    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1234 aa  2472    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  95.62 
 
 		 1234 aa  2290    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  99.92 
 
 		 1250 aa  2467    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  95.63 
 
 		 1252 aa  2312    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  99.51 
 
 		 1234 aa  2459    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  82.23 
 
 		 1254 aa  1998    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  31.62 
 
 		 1806 aa  243  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  31.34 
 
 		 1327 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  31.16 
 
 		 1594 aa  233  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  31.34 
 
 		 466 aa  224  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  30.09 
 
 		 2637 aa  219  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  31.17 
 
 		 1579 aa  215  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  28.84 
 
 		 773 aa  209  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1165 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1165 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  30.38 
 
 		 4312 aa  204  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  29.96 
 
 		 4391 aa  203  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  30.4 
 
 		 1327 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  30.22 
 
 		 1349 aa  199  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  30.22 
 
 		 1327 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.46 
 
 		 3322 aa  196  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  29.19 
 
 		 2057 aa  191  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  33.88 
 
 		 989 aa  185  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.8 
 
 		 868 aa  170  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  25.68 
 
 		 1102 aa  166  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  30.88 
 
 		 955 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  30.59 
 
 		 955 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  32.17 
 
 		 338 aa  154  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  34.3 
 
 		 1626 aa  147  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  30.96 
 
 		 306 aa  140  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  25.77 
 
 		 950 aa  138  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.6 
 
 		 806 aa  135  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  29.47 
 
 		 1234 aa  135  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  28 
 
 		 1108 aa  128  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  28.43 
 
 		 1277 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  25.84 
 
 		 1113 aa  125  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  27.31 
 
 		 1012 aa  121  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  27.44 
 
 		 3415 aa  119  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 		 3420 aa  116  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.49 
 
 		 2926 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  26.2 
 
 		 995 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  27.42 
 
 		 819 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  27.05 
 
 		 818 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.09 
 
 		 1099 aa  103  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.83 
 
 		 825 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  28.65 
 
 		 1268 aa  99.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  26.68 
 
 		 2906 aa  99  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27.64 
 
 		 1254 aa  98.2  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  26.82 
 
 		 2578 aa  97.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  24.86 
 
 		 997 aa  97.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.44 
 
 		 1086 aa  97.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  27.1 
 
 		 1571 aa  97.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.34 
 
 		 1259 aa  96.3  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  27.39 
 
 		 1259 aa  96.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.03 
 
 		 1285 aa  95.9  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27.54 
 
 		 1269 aa  96.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  24.2 
 
 		 1004 aa  95.5  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  26.82 
 
 		 1861 aa  95.5  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.34 
 
 		 1023 aa  89.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  26.57 
 
 		 1093 aa  89  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  26.57 
 
 		 1093 aa  89  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  30.14 
 
 		 861 aa  89  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  24.8 
 
 		 1028 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  24.67 
 
 		 733 aa  82.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  24.82 
 
 		 1741 aa  81.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.67 
 
 		 1067 aa  80.1  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.51 
 
 		 1748 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  25.61 
 
 		 773 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  25.29 
 
 		 729 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.72 
 
 		 731 aa  75.1  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  26.24 
 
 		 1593 aa  74.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  40.62 
 
 		 1068 aa  74.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.01 
 
 		 1753 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  24.44 
 
 		 769 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  26.46 
 
 		 1762 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  27.48 
 
 		 1770 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  26.46 
 
 		 1762 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  26.24 
 
 		 1763 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.38 
 
 		 1357 aa  72  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 		 1770 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.87 
 
 		 709 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  26.48 
 
 		 1040 aa  65.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.67 
 
 		 1070 aa  65.1  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.45 
 
 		 1070 aa  62.4  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  30.95 
 
 		 1144 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  25.4 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  25.4 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  23.12 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.24 
 
 		 1122 aa  58.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.76 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  38.14 
 
 		 947 aa  56.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  22.93 
 
 		 1008 aa  56.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  27.62 
 
 		 909 aa  55.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  34.67 
 
 		 1049 aa  55.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  24.83 
 
 		 765 aa  55.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  35 
 
 		 506 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  35 
 
 		 506 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  24.3 
 
 		 730 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  26.46 
 
 		 2642 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>