More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1061 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  99.49 
 
 
197 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  99.49 
 
 
196 aa  391  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.38048e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  98.98 
 
 
196 aa  390  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  5.06874e-10  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  99.49 
 
 
197 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.08072e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  99.49 
 
 
197 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  99.49 
 
 
197 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  5.87917e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
197 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  3.7652e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  99.49 
 
 
197 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  5.06013e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  98.98 
 
 
197 aa  391  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.10847e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  92.35 
 
 
250 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  92.35 
 
 
241 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  92.35 
 
 
196 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  92.35 
 
 
196 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  92.35 
 
 
196 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  89.85 
 
 
197 aa  364  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.90441e-07  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  67.01 
 
 
190 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.60031e-07  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  59.9 
 
 
192 aa  239  3e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  3.64467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  59.9 
 
 
192 aa  239  3e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.65498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  59.9 
 
 
192 aa  239  3e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.95394e-12  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  58.29 
 
 
195 aa  238  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 
195 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  59.18 
 
 
195 aa  234  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  57.29 
 
 
195 aa  233  2e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  55.37 
 
 
198 aa  211  5e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  52.5 
 
 
198 aa  157  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  45.99 
 
 
209 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  49.13 
 
 
187 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  43.75 
 
 
211 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  46.11 
 
 
186 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  46.96 
 
 
189 aa  152  3e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  48.75 
 
 
212 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  46.35 
 
 
194 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  51.63 
 
 
187 aa  151  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  47.2 
 
 
194 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.6941e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  51.63 
 
 
187 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  44.24 
 
 
200 aa  147  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0916  co-chaperone GrpE  49.13 
 
 
206 aa  146  1e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.764305  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  47.16 
 
 
210 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  49.11 
 
 
189 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  47.71 
 
 
195 aa  145  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  40.8 
 
 
200 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.63848e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
189 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 
185 aa  144  7e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  48.39 
 
 
185 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  45.45 
 
 
245 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  42.93 
 
 
209 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  49.02 
 
 
184 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  43.58 
 
 
206 aa  140  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  43.58 
 
 
206 aa  140  1e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.75754e-08  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  43.58 
 
 
203 aa  140  1e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.69534e-09  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  43.58 
 
 
203 aa  140  1e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.98857e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  46.38 
 
 
200 aa  139  2e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.5112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  46.38 
 
 
204 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  47.14 
 
 
205 aa  138  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.76111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  43.79 
 
 
186 aa  137  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  43.02 
 
 
206 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.25429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  40.89 
 
 
209 aa  135  3e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  4.35816e-05  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 
206 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.27789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 
206 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  7.98826e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 
206 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.67299e-10  decreased coverage  7.11999e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  42.46 
 
 
206 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63417e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  43 
 
 
187 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  47.1 
 
 
184 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  46.36 
 
 
185 aa  132  4e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  45.93 
 
 
193 aa  131  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  46.11 
 
 
184 aa  130  1e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  47.37 
 
 
210 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  44.87 
 
 
201 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.57049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  41.9 
 
 
201 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.03997e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.52 
 
 
208 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  44.93 
 
 
192 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  39.78 
 
 
199 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  45.59 
 
 
189 aa  120  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  41.57 
 
 
190 aa  120  1e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  44.67 
 
 
199 aa  120  1e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  45.65 
 
 
193 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  50.7 
 
 
207 aa  117  8e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36 
 
 
190 aa  117  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
178 aa  117  1e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
185 aa  117  2e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
185 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
185 aa  117  2e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
185 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
185 aa  117  2e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
185 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  45.65 
 
 
181 aa  116  2e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.46 
 
 
189 aa  116  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  44.93 
 
 
185 aa  117  2e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 
213 aa  116  2e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  40.8 
 
 
171 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 
181 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 
181 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  39.23 
 
 
200 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 
181 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  38.58 
 
 
208 aa  114  7e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  37.97 
 
 
218 aa  114  8e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  40.11 
 
 
172 aa  114  1e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  38.98 
 
 
205 aa  114  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  42.75 
 
 
181 aa  113  2e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 
172 aa  113  2e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>