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for query gene EcDH1_1021 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  98.83 
 
 		 426 aa  863    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 426 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  98.83 
 
 		 426 aa  863    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  73.22 
 
 		 425 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  73.46 
 
 		 425 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  88.5 
 
 		 427 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  99.06 
 
 		 426 aa  867    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  88.73 
 
 		 427 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  88.5 
 
 		 427 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  99.53 
 
 		 426 aa  870    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  73.93 
 
 		 425 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  98.83 
 
 		 426 aa  866    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  73.22 
 
 		 425 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  75.59 
 
 		 440 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  73.7 
 
 		 426 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  73.46 
 
 		 426 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  99.53 
 
 		 426 aa  870    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  88.73 
 
 		 427 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  98.35 
 
 		 426 aa  855    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  73.22 
 
 		 425 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  73.93 
 
 		 426 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  73.46 
 
 		 426 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  72.04 
 
 		 426 aa  614  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1172  4-aminobutyrate aminotransferase  70.31 
 
 		 425 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.408586  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3186  4-aminobutyrate aminotransferase  70.31 
 
 		 425 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.365354  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1100  4-aminobutyrate aminotransferase  70.55 
 
 		 425 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.840531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1114  4-aminobutyrate aminotransferase  70.07 
 
 		 425 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1205  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 		 425 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.60622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  68.96 
 
 		 425 aa  588  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0952  4-aminobutyrate aminotransferase  69.43 
 
 		 425 aa  588  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  70.55 
 
 		 425 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.51273  normal  0.448199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2994  4-aminobutyrate aminotransferase  70.55 
 
 		 425 aa  584  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.235499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  68.81 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  68.1 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3091  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 		 425 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0318031  normal  0.465218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1276  4-aminobutyrate aminotransferase  70.07 
 
 		 425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  64.69 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  64.44 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  63.9 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  61.72 
 
 		 432 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  60.58 
 
 		 434 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  60.24 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  56.94 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  56.77 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  57.83 
 
 		 421 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  52.37 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  53.92 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  54.16 
 
 		 446 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  54.69 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  51.3 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  53.92 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  54.29 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  55.11 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  54.87 
 
 		 426 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  53.68 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  57.28 
 
 		 422 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  53.32 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  53.68 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  53.68 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  53.1 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  56.27 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  53.08 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  56.8 
 
 		 426 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  54.89 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  53.83 
 
 		 421 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  52.84 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  52.64 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  54.87 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  55.5 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  54.87 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  54.63 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  55.71 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  53.1 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  54.87 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  56.26 
 
 		 425 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  54.87 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  54.05 
 
 		 422 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  54.87 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  54.39 
 
 		 421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  56.35 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  54.95 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  54.63 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  51.08 
 
 		 419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  55.9 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  54.63 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  53.92 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  51.32 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  53.66 
 
 		 425 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  52.83 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  50.84 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  54.39 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  53.81 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  53.94 
 
 		 421 aa  438  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  53.08 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  51.31 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  52.96 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  52.84 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  48.58 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  53.32 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II2119  4-aminobutyrate aminotransferase  54.03 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22947  n/a   
 
 
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