96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0750 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  100 
 
 
235 aa  494  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  99.57 
 
 
235 aa  493  1e-138  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  99.57 
 
 
235 aa  493  1e-138  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  99.57 
 
 
235 aa  493  1e-138  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  99.57 
 
 
235 aa  493  1e-138  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  99.57 
 
 
235 aa  493  1e-138  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  99.15 
 
 
235 aa  492  1e-138  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  5.16595e-08  unclonable  1.97257e-08 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  98.72 
 
 
235 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  2.98257e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  98.72 
 
 
235 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  83.83 
 
 
235 aa  431  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  3.15843e-08  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3340  endonuclease I  87.23 
 
 
235 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00611255  normal  0.202483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3436  endonuclease I  87.23 
 
 
235 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00127424  hitchhiker  0.00168464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3256  endonuclease I  87.23 
 
 
235 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.48246e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3332  endonuclease I  87.23 
 
 
235 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.387366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3267  endonuclease I  87.23 
 
 
235 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0010351  normal  0.0484419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  77.25 
 
 
233 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.36601e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0839  endonuclease I  78.97 
 
 
235 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  73.59 
 
 
232 aa  374  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  7.96266e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  73.59 
 
 
232 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.80912e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0841  deoxyribonuclease I  78.97 
 
 
235 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  2.39428e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3345  endonuclease I  78.97 
 
 
235 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  73.59 
 
 
232 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.39034e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4024  deoxyribonuclease I  73.68 
 
 
231 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.63525e-10  decreased coverage  0.000370071 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002464  endonuclease I precursor  65.62 
 
 
231 aa  320  1e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  67.94 
 
 
231 aa  315  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  60.17 
 
 
237 aa  309  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0022  extracellular deoxyribonuclease  60.52 
 
 
231 aa  305  4e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4133  deoxyribonuclease I  56.9 
 
 
251 aa  283  1e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  56.49 
 
 
258 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  2.67909e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  57.92 
 
 
251 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  3.96495e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0691  deoxyribonuclease I  55.65 
 
 
257 aa  274  1e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  4.38774e-09  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3331  deoxyribonuclease I  55.65 
 
 
257 aa  273  1e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  8.77394e-07  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3443  endonuclease I  55.23 
 
 
257 aa  273  2e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.11641e-08  hitchhiker  0.00909149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  54.81 
 
 
258 aa  272  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  55.23 
 
 
259 aa  272  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  6.48022e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0810  deoxyribonuclease I  60.28 
 
 
258 aa  272  4e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.71872e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0835  Deoxyribonuclease I  59.81 
 
 
258 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.25063e-09  hitchhiker  1.04704e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3525  deoxyribonuclease I  59.35 
 
 
258 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.00295e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3971  deoxyribonuclease I  58.1 
 
 
251 aa  268  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0576  deoxyribonuclease I  52.59 
 
 
242 aa  263  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.05466e-07  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2973  deoxyribonuclease I  52.16 
 
 
269 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.576725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0544  deoxyribonuclease I  56.89 
 
 
254 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  54.19 
 
 
321 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  53.74 
 
 
321 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  53.74 
 
 
321 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  51.09 
 
 
323 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1915  deoxyribonuclease I  55.61 
 
 
229 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468697  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2364  endonuclease I  52.21 
 
 
233 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2148  deoxyribonuclease I  52.47 
 
 
233 aa  234  1e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.04352e-08  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3521  deoxyribonuclease I  53.36 
 
 
230 aa  233  1e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.271071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02310  Deoxyribonuclease I  52.68 
 
 
268 aa  233  2e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40130  deoxyribonuclease I  52.29 
 
 
231 aa  231  7e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0550387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3242  deoxyribonuclease I  53.12 
 
 
230 aa  231  8e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.187326  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2451  deoxyribonuclease I  51.57 
 
 
230 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1350  deoxyribonuclease I  50.67 
 
 
232 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28570  DNA-specific endonuclease I  50 
 
 
237 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.74219e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2493  DNA-specific endonuclease I  50 
 
 
237 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4374  deoxyribonuclease I  51.71 
 
 
288 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  6.99204e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0624  deoxyribonuclease I  51.71 
 
 
241 aa  205  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00856225  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  46.81 
 
 
243 aa  201  1e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  46.81 
 
 
229 aa  198  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  46.38 
 
 
229 aa  197  2e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2580  deoxyribonuclease I  37.14 
 
 
256 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0601  deoxyribonuclease I  38.87 
 
 
250 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0256  extracellular deoxyribonuclease  36.8 
 
 
223 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4577  deoxyribonuclease I  36.03 
 
 
243 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.54925e-18  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1458  Deoxyribonuclease I  42.08 
 
 
249 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.118773  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4415  deoxyribonuclease I  36.65 
 
 
243 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.69182e-28  decreased coverage  0.000909905 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4599  deoxyribonuclease I  36.65 
 
 
243 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26401e-21  normal  0.918023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  33.09 
 
 
211 aa  76.6  3e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  25.32 
 
 
232 aa  66.2  4e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  27.46 
 
 
285 aa  61.2  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  24.22 
 
 
219 aa  56.2  4e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  26.15 
 
 
617 aa  55.1  1e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  27.87 
 
 
341 aa  53.1  4e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  28.57 
 
 
539 aa  52.8  5e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  29.23 
 
 
542 aa  50.1  3e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.63328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  25.79 
 
 
311 aa  50.1  3e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  27.83 
 
 
272 aa  49.7  4e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  27.08 
 
 
539 aa  49.3  5e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  23.95 
 
 
614 aa  49.3  5e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  26.72 
 
 
558 aa  48.9  6e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  26.72 
 
 
558 aa  48.9  7e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  25.69 
 
 
538 aa  48.9  7e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  29.46 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  29.23 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  29.23 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  29.46 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  29.46 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  27.61 
 
 
1346 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  25.78 
 
 
1310 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  27.91 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  26.56 
 
 
1503 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  26.81 
 
 
365 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  25.17 
 
 
308 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  25.56 
 
 
314 aa  42.7  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>