165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0661 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  100 
 
 
257 aa  497  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  98.44 
 
 
253 aa  484  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  92.61 
 
 
257 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  92.61 
 
 
257 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  92.61 
 
 
257 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  92.61 
 
 
257 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  92.61 
 
 
257 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  90.27 
 
 
257 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  82.88 
 
 
255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  39.86 
 
 
291 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  40 
 
 
291 aa  181  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  39.53 
 
 
265 aa  171  9e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  36.26 
 
 
272 aa  168  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  40.08 
 
 
270 aa  165  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  36.82 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  39.36 
 
 
266 aa  161  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  39.46 
 
 
271 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  35.98 
 
 
277 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  37.04 
 
 
281 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  39.04 
 
 
266 aa  159  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  39.27 
 
 
275 aa  155  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  37.31 
 
 
269 aa  155  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  36.95 
 
 
267 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  34.25 
 
 
258 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  34.36 
 
 
298 aa  148  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  34.14 
 
 
298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 
279 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 
298 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  37.02 
 
 
280 aa  142  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  35.85 
 
 
269 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  40.77 
 
 
262 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  34.98 
 
 
265 aa  135  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  35.92 
 
 
289 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  34.84 
 
 
252 aa  132  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  40.26 
 
 
247 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  32.2 
 
 
300 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  42.95 
 
 
390 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  34.55 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  45.32 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  30.28 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  32.79 
 
 
237 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  31.58 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  31.14 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  35.32 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  31.87 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  30.43 
 
 
271 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  30.8 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  31.23 
 
 
271 aa  85.5  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  31.17 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  31.82 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  31.82 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  32.71 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  32.11 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  30.83 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  30.89 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  30.71 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  31.91 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  29.6 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  33.33 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  29.25 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  28.46 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  30.36 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  29.86 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  30.6 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  33.73 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  30.99 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  27.21 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  30.56 
 
 
304 aa  79  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  30.18 
 
 
261 aa  79  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  29.95 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  28.11 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  29.23 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  31.73 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  29.74 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  30.22 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  31.58 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  31.58 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  28.68 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  40.8 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.75 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  36.59 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  28.77 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0707  zinc/iron permease  32.28 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.259177  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  28.86 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  31.05 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0057  zinc/iron permease  35.59 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  32.14 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  31.43 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  31.56 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  33.2 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  32.07 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  28.63 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  33.33 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>