121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0569 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  99.48 
 
 
384 aa  792    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  100 
 
 
384 aa  795    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  80.73 
 
 
380 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  99.74 
 
 
384 aa  794    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  99.48 
 
 
384 aa  792    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  99.74 
 
 
384 aa  794    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  97.92 
 
 
384 aa  786    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  98.96 
 
 
384 aa  787    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  99.48 
 
 
384 aa  792    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  72.4 
 
 
384 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  45.58 
 
 
388 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  45.58 
 
 
388 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  48.66 
 
 
388 aa  333  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  47.83 
 
 
387 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  45.43 
 
 
386 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  42.78 
 
 
388 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  45.16 
 
 
386 aa  310  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  45.16 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  45.04 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  38.18 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  38.18 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  40.57 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  41.05 
 
 
388 aa  282  6.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  38.62 
 
 
390 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  38.62 
 
 
390 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  41.42 
 
 
388 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  38.27 
 
 
384 aa  266  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  36.94 
 
 
376 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  42.9 
 
 
384 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  41.47 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  40.48 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  34.12 
 
 
400 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.86 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  27.76 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  29.32 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  25.61 
 
 
317 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.08 
 
 
613 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2621  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.15 
 
 
630 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.204454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.2 
 
 
612 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.2 
 
 
612 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3639  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.16 
 
 
609 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000255668  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1739  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 
628 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15236  normal  0.181202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.53 
 
 
610 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  22.48 
 
 
302 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2210  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.05 
 
 
609 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0080  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.56 
 
 
614 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0166256  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1487  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.73 
 
 
609 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2912  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.71 
 
 
630 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.379512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2611  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.66 
 
 
622 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0089  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.84 
 
 
614 aa  50.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.86 
 
 
616 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.362507  normal  0.0290397 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.58 
 
 
330 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1372  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.24 
 
 
613 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.742215  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4716  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.57 
 
 
605 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1692  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.13 
 
 
617 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.96 
 
 
610 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0832  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.18 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  22.15 
 
 
610 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.01 
 
 
591 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.66 
 
 
611 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2605  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25 
 
 
634 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.02871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.12 
 
 
610 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4102  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.91 
 
 
611 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2705  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.37 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0596845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  24.39 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.44 
 
 
610 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.84 
 
 
609 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.53 
 
 
614 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4069  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.91 
 
 
611 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.321445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3743  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.52 
 
 
609 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0004  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25 
 
 
349 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00308372  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3920  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.87 
 
 
609 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121785  normal  0.0336662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 
609 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000322632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.06 
 
 
610 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3951  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.87 
 
 
609 aa  46.6  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.42 
 
 
610 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  24.72 
 
 
610 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4198  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.15 
 
 
611 aa  46.2  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01415  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.69 
 
 
615 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.87 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0005  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.63 
 
 
575 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  24.72 
 
 
611 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4012  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.87 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0405163  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.87 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.52 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4502  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.52 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782513  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4598  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.42 
 
 
606 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4305  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.52 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.312496  hitchhiker  0.000000000243426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6153  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  25.64 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311878  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3959  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  22.6 
 
 
611 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318136  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3838  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.74 
 
 
611 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4361  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.87 
 
 
609 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1359  putative aminotransferase  26.17 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.19 
 
 
609 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4234  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.52 
 
 
609 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235934  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  23.08 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4892  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 
609 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.664271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2000  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.31 
 
 
611 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4942  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.53 
 
 
610 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.55 
 
 
629 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.529211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>