More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0529 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.5 
 
 
631 aa  719  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.31 
 
 
640 aa  787  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.96 
 
 
657 aa  1006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.53792e-06  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.35 
 
 
638 aa  681  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.96 
 
 
646 aa  729  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.97526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.03 
 
 
650 aa  990  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.74852e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  94.07 
 
 
643 aa  1244  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.99281e-05  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  76.96 
 
 
659 aa  1001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.36506e-06  decreased coverage  4.2164e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  100 
 
 
647 aa  1324  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.24409e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  100 
 
 
647 aa  1324  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  79.01 
 
 
658 aa  1040  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  66.51 
 
 
650 aa  851  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.67 
 
 
640 aa  714  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.14 
 
 
631 aa  717  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  66.61 
 
 
647 aa  853  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  76.56 
 
 
657 aa  1004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.20805e-05  hitchhiker  6.81699e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.44 
 
 
640 aa  709  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.83 
 
 
634 aa  853  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  99.85 
 
 
647 aa  1320  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.79508e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  100 
 
 
644 aa  1318  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.77959e-06  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  91.19 
 
 
647 aa  1220  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.70783e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.17 
 
 
620 aa  639  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.46 
 
 
626 aa  709  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.98 
 
 
634 aa  847  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.58 
 
 
611 aa  640  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.70708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.33 
 
 
642 aa  702  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  91.04 
 
 
647 aa  1218  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.9949e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.26 
 
 
641 aa  755  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  91.15 
 
 
644 aa  1214  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.83259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.19 
 
 
634 aa  679  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  78.03 
 
 
657 aa  1004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.56985e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  96.27 
 
 
644 aa  1276  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.13 
 
 
633 aa  647  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.6 
 
 
621 aa  726  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.62 
 
 
655 aa  1018  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.17945e-06  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  59.15 
 
 
628 aa  715  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 
628 aa  715  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 
628 aa  715  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.96 
 
 
657 aa  1006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.31825e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.47 
 
 
633 aa  649  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  59.15 
 
 
628 aa  715  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  64.53 
 
 
640 aa  805  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.51 
 
 
640 aa  848  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  80.41 
 
 
651 aa  1049  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  7.21667e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.68 
 
 
651 aa  737  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.96 
 
 
657 aa  1006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.87677e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  70.1 
 
 
642 aa  846  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.62 
 
 
659 aa  812  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.08375e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.82 
 
 
645 aa  718  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.6 
 
 
627 aa  659  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.88844e-07  unclonable  1.75333e-09 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.68 
 
 
634 aa  847  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.72 
 
 
652 aa  733  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  59.71 
 
 
649 aa  730  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  59.67 
 
 
638 aa  728  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.21 
 
 
641 aa  745  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.83 
 
 
617 aa  717  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.9937e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.82 
 
 
651 aa  861  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.98 
 
 
701 aa  635  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.51 
 
 
637 aa  853  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.85 
 
 
639 aa  786  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  60.67 
 
 
681 aa  757  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.41 
 
 
637 aa  916  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.71 
 
 
640 aa  709  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.12 
 
 
635 aa  677  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.02 
 
 
676 aa  729  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.92 
 
 
671 aa  733  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  63.59 
 
 
641 aa  789  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.33 
 
 
642 aa  702  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.8 
 
 
643 aa  732  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  78.12 
 
 
652 aa  1007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  5.70756e-07  unclonable  9.18847e-12 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.18 
 
 
638 aa  782  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.44 
 
 
648 aa  729  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.82 
 
 
650 aa  850  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  79.84 
 
 
660 aa  1045  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.82706e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.86 
 
 
656 aa  875  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  7.29584e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  90.78 
 
 
651 aa  1199  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.53513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.29 
 
 
636 aa  723  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.21 
 
 
637 aa  737  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.63 
 
 
612 aa  724  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  93.84 
 
 
649 aa  1246  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  94.31 
 
 
650 aa  1247  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  100 
 
 
644 aa  1318  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  5.35271e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  91.74 
 
 
654 aa  1218  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  8.88182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.89 
 
 
628 aa  711  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.96 
 
 
630 aa  835  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.95 
 
 
643 aa  737  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.44 
 
 
643 aa  732  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.64 
 
 
642 aa  711  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  65.12 
 
 
646 aa  817  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.72 
 
 
628 aa  709  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.36 
 
 
629 aa  716  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  99.69 
 
 
647 aa  1322  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.14537e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.26 
 
 
629 aa  723  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.9 
 
 
640 aa  721  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.52 
 
 
645 aa  817  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.17 
 
 
631 aa  715  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.6 
 
 
621 aa  724  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.87 
 
 
634 aa  812  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  64.68 
 
 
645 aa  820  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.76 
 
 
635 aa  702  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.62887e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>