More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0434 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  380  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.74593e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  99.46 
 
 
256 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.98302e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  99.46 
 
 
184 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  8.50407e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  99.46 
 
 
184 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.2792e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.21267e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.08739e-09  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.54067e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  98.37 
 
 
184 aa  367  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.28421e-08  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  82.07 
 
 
184 aa  311  3e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  3.68449e-06  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  74.16 
 
 
180 aa  275  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.87962e-09  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  74.44 
 
 
182 aa  275  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  73.33 
 
 
182 aa  273  1e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  71.35 
 
 
178 aa  268  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  3.1956e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  73.03 
 
 
178 aa  266  9e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  71.35 
 
 
180 aa  259  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.87366e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  71.35 
 
 
180 aa  259  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.2748e-08  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  71.35 
 
 
180 aa  259  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.17644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  65.52 
 
 
177 aa  248  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  63.07 
 
 
182 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  64.41 
 
 
184 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.49932e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  62.29 
 
 
185 aa  244  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  60.89 
 
 
179 aa  243  1e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  64.37 
 
 
179 aa  241  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  63.01 
 
 
179 aa  241  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  63.43 
 
 
181 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  61.36 
 
 
182 aa  240  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  61.36 
 
 
182 aa  240  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  61.36 
 
 
182 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  63.79 
 
 
183 aa  238  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  62.64 
 
 
192 aa  238  3e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  63.48 
 
 
181 aa  238  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  3.67586e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  59.43 
 
 
181 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  63.22 
 
 
182 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.48613e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
181 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  5.44891e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  60.23 
 
 
181 aa  235  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  60 
 
 
180 aa  234  5e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  58.86 
 
 
180 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  58.86 
 
 
180 aa  234  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  233  1e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.98121e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  233  1e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.54133e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  233  2e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.11727e-08  unclonable  9.97439e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  61.93 
 
 
182 aa  232  2e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  6.02369e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  61.93 
 
 
182 aa  232  2e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.08164e-06  unclonable  4.48586e-12 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  59.2 
 
 
180 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  60.11 
 
 
182 aa  230  7e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  7.2443e-07  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  60.11 
 
 
182 aa  229  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  59.43 
 
 
184 aa  229  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.62772e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  60.11 
 
 
182 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.33363e-05  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  60.11 
 
 
182 aa  228  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.41842e-07  hitchhiker  1.0839e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  58.99 
 
 
182 aa  228  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  3.73213e-06  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  62.36 
 
 
180 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  58.05 
 
 
179 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  53.26 
 
 
185 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  59.43 
 
 
185 aa  222  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.8127e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  56.82 
 
 
184 aa  220  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.06421e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  59.22 
 
 
179 aa  216  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  56 
 
 
180 aa  209  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  53.76 
 
 
180 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  53.98 
 
 
177 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  53.45 
 
 
176 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  49.71 
 
 
185 aa  199  1e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  51.7 
 
 
178 aa  199  2e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  52.05 
 
 
179 aa  198  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  51.16 
 
 
176 aa  197  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  55.23 
 
 
179 aa  195  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  54.65 
 
 
176 aa  195  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  51.1 
 
 
189 aa  190  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  50 
 
 
187 aa  188  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  50 
 
 
187 aa  187  6e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  51.74 
 
 
181 aa  186  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  51.45 
 
 
169 aa  183  1e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  4.53095e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  51.16 
 
 
187 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  48.3 
 
 
174 aa  174  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  47.43 
 
 
179 aa  171  6e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  48.55 
 
 
175 aa  169  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  45.76 
 
 
175 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  45.76 
 
 
175 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  45.2 
 
 
175 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  41.95 
 
 
183 aa  164  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  45.2 
 
 
177 aa  162  4e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.71733e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  44.83 
 
 
177 aa  161  5e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.67215e-05  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  41.57 
 
 
182 aa  160  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.83 
 
 
177 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.83 
 
 
177 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  41.01 
 
 
182 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  41.01 
 
 
182 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  43.18 
 
 
186 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1936  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  43.65 
 
 
177 aa  158  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  47.88 
 
 
175 aa  157  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  46.71 
 
 
175 aa  152  3e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  42.37 
 
 
189 aa  150  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  43.6 
 
 
170 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  8.49084e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0045  hexapeptide transferase family protein  42.78 
 
 
185 aa  150  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0961185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  49.68 
 
 
174 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  41.81 
 
 
177 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0290  acetyltransferase  42.69 
 
 
180 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0175113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 
180 aa  148  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  41.48 
 
 
224 aa  147  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2541  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  41.57 
 
 
171 aa  145  2e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>