More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0074 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  90.11 
 
 		 374 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 374 aa  783    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  86.36 
 
 		 374 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  86.1 
 
 		 374 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.84 
 
 		 374 aa  706    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  86.36 
 
 		 374 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  90.11 
 
 		 374 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  86.36 
 
 		 374 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  90.11 
 
 		 374 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  89.84 
 
 		 374 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.3 
 
 		 374 aa  705    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  90.37 
 
 		 374 aa  713    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  85.83 
 
 		 374 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  89.84 
 
 		 374 aa  709    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  59.78 
 
 		 371 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  52.17 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  51.08 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  51.35 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  51.08 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  51.35 
 
 		 374 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  51.36 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  51.62 
 
 		 374 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  51.08 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  50.82 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  50.82 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  50.27 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  46.52 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  43.51 
 
 		 378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  38.02 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  38.97 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  38.21 
 
 		 373 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 361 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.32 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  27.67 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  30.77 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.13 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  26.77 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  27.5 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  29.79 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 672 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  30.1 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  26.71 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  26.71 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  26.75 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.38 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.75 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  31.8 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25.07 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  34.29 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  28.07 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 930 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4915  hypothetical protein  27.11 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.327888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>