292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1008 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
125 aa  246  7e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0814  protein translocase subunit yajC  85.04 
 
 
148 aa  172  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.0000182251  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  62.39 
 
 
123 aa  139  9e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  47.87 
 
 
94 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  45.37 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  46.36 
 
 
109 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  44.55 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  41.41 
 
 
143 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  39.42 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  47.19 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  46.73 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  47.78 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 
109 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  46.43 
 
 
105 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  39.34 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  42.31 
 
 
117 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  43.43 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  47.67 
 
 
178 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  47.19 
 
 
108 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  43.01 
 
 
111 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 
110 aa  88.6  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  44.09 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  45.24 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  40.37 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  45.45 
 
 
94 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  45.54 
 
 
108 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  42.39 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  44.68 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 
93 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  47.19 
 
 
108 aa  86.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  44.12 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  44.12 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  44.12 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  44.12 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  44.12 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  44.12 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  39.81 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  44.12 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  44.12 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  45.1 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  45.1 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  39.81 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  45.1 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  34.43 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  42.86 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  43.93 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  43.48 
 
 
118 aa  84.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  43.14 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 
118 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  37.96 
 
 
110 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  45.1 
 
 
110 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  42.35 
 
 
93 aa  84  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  39.33 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  43.14 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  43.14 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  43.14 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  43.14 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  43.14 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 
117 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  42.57 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  37.62 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  38.38 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  42.7 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  44.83 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  41.59 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  36.63 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  39.77 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>