297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0850 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0850  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.031083  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0018  tRNA-Gly  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.045305  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.78 
 
 
73 bp  97.6  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0046  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.100607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0038  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0048  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.395068  normal  0.100997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0036  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0040  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.291928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0037  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0012  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000030086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0056  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.666652  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0048  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.950011  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0006  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0012  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0042  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0059  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0040  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0001  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0013  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.155997  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0013  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0023  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.881928  decreased coverage  0.000601016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0045  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.970525  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0023  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0011  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15715  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0670203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0012  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  89.29 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0007  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38046  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0008  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.521069  normal  0.137143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0010  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0183648  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0011  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189019  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0043  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0095  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02271  normal  0.395176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t009  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t010  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t033  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t041  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0170  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.925089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0069  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000142441  normal  0.203566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0018  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103961  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0059  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000852729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0016  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000912606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0108  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.038773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0069  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000101194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0027  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425425  hitchhiker  0.000935179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0121  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0591922  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0120  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0581701  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0091  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0098  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0095  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000455867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0171  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.711863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0167  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0122  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0586891  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0109  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0415869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0017  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0015  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000023948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0055  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0064  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0111  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0112  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00598062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0113  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0059  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0088  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0169  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0168  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0166  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0047  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000233996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0070  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0206206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0091  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000341409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0110  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0760106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0065  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000604165  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0123  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000452322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0122  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000463735  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0125  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0124  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0025  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0691612  hitchhiker  0.000941465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0024  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0701106  hitchhiker  0.000966251 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t03  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0024  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0025  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0026  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0027  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0079  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000539441  normal  0.0509646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0091  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000165376  normal  0.0217051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0061  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664569  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0069  tRNA-Gly  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000532725  normal  0.462628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>