More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0842 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  100 
 
 
282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  84.04 
 
 
287 aa  488  1e-137  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  47.41 
 
 
293 aa  231  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  29.47 
 
 
332 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  32.66 
 
 
303 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 
313 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  32.97 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 
344 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  31.15 
 
 
308 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  32.97 
 
 
295 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 
351 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.78 
 
 
334 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.78 
 
 
334 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  30.77 
 
 
297 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  27.15 
 
 
329 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  28.01 
 
 
339 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  26.81 
 
 
346 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  25.67 
 
 
347 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 
313 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  26.22 
 
 
311 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.97 
 
 
339 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.79 
 
 
310 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.76 
 
 
314 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  24.91 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.79 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  26.79 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.79 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.41 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.41 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.26 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.41 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  26.26 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.79 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.41 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.79 
 
 
310 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  24.47 
 
 
302 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.43 
 
 
310 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.79 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  24.11 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  26.56 
 
 
334 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  25.54 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  23.84 
 
 
318 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.46 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.73 
 
 
340 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.91 
 
 
314 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.08 
 
 
318 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.08 
 
 
318 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  27.21 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.81 
 
 
340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 
326 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  32.74 
 
 
371 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  33.93 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  30.54 
 
 
369 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  30.95 
 
 
378 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  24.3 
 
 
301 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  31.55 
 
 
356 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  20.27 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.44 
 
 
514 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 
318 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  24.18 
 
 
301 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  26.74 
 
 
506 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25.64 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  31.95 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26.47 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  24.22 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  28.17 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  24.89 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  26.04 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.78 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.78 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.78 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  23.02 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  22.52 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  23.89 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2032  ABC zinc transporter, periplasmic solute binding protein ZnuA  25.74 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216012  decreased coverage  0.00438376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  29.67 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  25.21 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  24.2 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  22.17 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.39 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.38 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.38 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  24.62 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2335  periplasmic solute binding protein  26.48 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  27.38 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  26.98 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  23.14 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  23.87 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  23.35 
 
 
318 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  21.43 
 
 
320 aa  79  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  26.59 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>