More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0728 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0728  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  84.46 
 
 		 301 aa  518  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  41.2 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  40.86 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  39.2 
 
 		 412 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  42.71 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  40.53 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  39.68 
 
 		 318 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  40.86 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 387 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  40.4 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  40.86 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  40.8 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  47.42 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  39.06 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  40.88 
 
 		 354 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  41.75 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  41.28 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  39.74 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  38.8 
 
 		 310 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4385  tRNA pseudouridine synthase B  39.8 
 
 		 310 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.5296 
 
 
-
 
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  46.01 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  40.2 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  46.01 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  38.16 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  40.07 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  39.46 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  39.26 
 
 		 341 aa  215  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  39.26 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  37.99 
 
 		 320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  37.46 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  38.93 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  37.76 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2801  tRNA pseudouridine synthase B  47.39 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  37.41 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  37.79 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  37.76 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  37.93 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0541  tRNA pseudouridine synthase B  35.28 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.578827  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2484  tRNA pseudouridine synthase B  38.41 
 
 		 304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  42.79 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  33.88 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  37.89 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  40.33 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  37.97 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  38.27 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  43.13 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0101  tRNA pseudouridine synthase B  41.92 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.374766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  38.79 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  39.92 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  38.89 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  40.25 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  35.63 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  37.86 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  34.74 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  34.74 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  35.63 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.18 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  37.21 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  37.04 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  33.22 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  34.74 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  41.51 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  33 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  35.69 
 
 		 291 aa  165  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  35.97 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  35.57 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3724  tRNA pseudouridine synthase B  34.36 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  35.23 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0612  tRNA pseudouridine synthase B  41.29 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.259864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  39.44 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  36.51 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  35.74 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  35.45 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  34.96 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1225  tRNA pseudouridine synthase B  35.36 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  36.18 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  34.88 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  39.44 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  35.93 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  35.68 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  35.25 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  40.57 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  35.25 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  35.18 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  31.56 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2205  tRNA pseudouridine synthase B  39.81 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.344514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  35.27 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  39.07 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0557  tRNA pseudouridine synthase B  38.57 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0393  tRNA pseudouridine synthase B  38.57 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  39.72 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  36.04 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>