More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0413 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0413  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.360055  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0608  30S ribosomal protein S19  98.92 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0677  30S ribosomal protein S19  60.64 
 
 		 94 aa  120  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.082813  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0270  ribosomal protein S19  58.06 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778686  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0763  30S ribosomal protein S19  53.76 
 
 		 92 aa  105  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.039039  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0589  30S ribosomal protein S19  52.69 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0286  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  103  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1720  30S ribosomal protein S19  53.76 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144462  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0365  30S ribosomal protein S19  53.76 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0253  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.802843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2530  30S ribosomal protein S19  53.76 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  53.26 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1434  30S ribosomal protein S19  52.69 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739133  normal  0.0341857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  52.69 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3663  30S ribosomal protein S19  55.06 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1336  30S ribosomal protein S19  52.69 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.665765  normal  0.112585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5066  30S ribosomal protein S19  53.26 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328593 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2970  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1192  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.327389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1229  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1368  30S ribosomal protein S19  53.26 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.177351  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0990  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496511  normal  0.0261086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2299  30S ribosomal protein S19  53.93 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1844  30S ribosomal protein S19  49.46 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00983892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1358  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.258972  normal  0.0314174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  54.35 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1549  30S ribosomal protein S19  53.26 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1912  30S ribosomal protein S19  49.46 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3180  30S ribosomal protein S19  53.93 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0349  30S ribosomal protein S19  49.46 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1960  30S ribosomal protein S19  50.54 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019333  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  49.46 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1618  30S ribosomal protein S19  47.31 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421333  normal  0.310007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0576  30S ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  49.46 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3444  30S ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  52.22 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2444  30S ribosomal protein S19  47.31 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2166  30S ribosomal protein S19  47.31 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2127  30S ribosomal protein S19  47.31 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.472693  normal  0.428993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2222  30S ribosomal protein S19  47.31 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  50.54 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  46.74 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0057  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000698135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  51.09 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  49.46 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  48.31 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0054  30S ribosomal protein S19  51.61 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000130645  hitchhiker  4.7991899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2814  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311339  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  47.31 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  47.31 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  50.56 
 
 		 90 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  50.56 
 
 		 93 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  50.54 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  48.39 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  49.46 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  43.01 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0458  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000166272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0488  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  45.16 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4745  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00116021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  52.17 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0491  30S ribosomal protein S19  48.91 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000257867  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  43.01 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  45.65 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  43.01 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  41.94 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  46.24 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>