131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0405 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  100 
 
 
83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  98.8 
 
 
83 bp  157  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  92.65 
 
 
86 bp  95.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  85.54 
 
 
83 bp  69.9  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.074992  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0263  tRNA-Tyr  87.88 
 
 
83 bp  67.9  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  95 
 
 
86 bp  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  95 
 
 
86 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  95 
 
 
86 bp  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0009  tRNA-Tyr  94.87 
 
 
83 bp  61.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  86.36 
 
 
86 bp  60  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  91.11 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  91.11 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  91.11 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0013  tRNA-Tyr  91.11 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000015326  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0024  tRNA-Tyr  91.11 
 
 
86 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0048  tRNA-Tyr  92.5 
 
 
86 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00025  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00075  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000048411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0049  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00226201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
83 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0054  tRNA-Tyr  92.31 
 
 
88 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000280744  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  83.13 
 
 
86 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
86 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0004  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000458141  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0047  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0048  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0054  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0083  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000525158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0043  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4231  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4288  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0052  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.573549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0006  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220808  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
83 bp  54  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4665  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00193221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4666  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000338441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4718  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.22023e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5031  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0188651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5032  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5101  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000185347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0012  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000806893  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0064  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0065  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695286  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2336  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000102833  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2800  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000115343  normal  0.0987715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0006  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000863158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0020  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.230904  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0021  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0056  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0058  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0108  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000394419  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1910  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178107  normal  0.179459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1911  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0172015  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4425  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181979  hitchhiker  0.0000468307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1446  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4663  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.25071e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5442  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000118281  hitchhiker  0.000431346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1716  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220424  normal  0.977011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1884  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1886  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0997724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4474  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000330783  hitchhiker  0.00000000000000918445 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1947  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1949  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4471  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000736073  hitchhiker  0.00060065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1890  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710503  normal  0.374202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1892  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.729122  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4352  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000588121  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1385  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1387  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0734169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4384  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000011593  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1568  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1570  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4549  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000121072 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0044  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0006  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000152746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0090  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000426682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1714  tRNA-Tyr  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0409502  normal  0.981337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00106012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt04  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt04  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0005  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.434844  hitchhiker  0.00676871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  91.89 
 
 
84 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0018  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0308  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.0000522223  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0024  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
86 bp  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0004  tRNA-Tyr  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000291052  hitchhiker  0.00000658966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0033  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000103069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>