More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0376 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  71.93 
 
 
464 aa  691    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  90.65 
 
 
461 aa  882    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  100 
 
 
461 aa  951    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  65.29 
 
 
510 aa  619  1e-176  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  63.97 
 
 
463 aa  609  1e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  63.32 
 
 
465 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  63.18 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  63.4 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  63.48 
 
 
544 aa  597  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  62.45 
 
 
463 aa  595  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  61.74 
 
 
464 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  62.39 
 
 
464 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  62.45 
 
 
478 aa  595  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  61.35 
 
 
474 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  61.57 
 
 
463 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  63.18 
 
 
472 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  63.32 
 
 
472 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  61.14 
 
 
462 aa  589  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  63.18 
 
 
469 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  63.4 
 
 
475 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  62.09 
 
 
469 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  61.74 
 
 
464 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  63.54 
 
 
463 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  62.01 
 
 
462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  60.96 
 
 
471 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  61.57 
 
 
482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  62.17 
 
 
492 aa  581  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  62.96 
 
 
469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  60.7 
 
 
466 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  61.79 
 
 
469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  61.18 
 
 
465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  62.66 
 
 
470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  61.05 
 
 
631 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  64.27 
 
 
464 aa  571  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  61.05 
 
 
464 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  61.05 
 
 
464 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  61.05 
 
 
464 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  60.92 
 
 
463 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  61.05 
 
 
464 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  62.23 
 
 
472 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  59.61 
 
 
465 aa  569  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  61.05 
 
 
464 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  61.05 
 
 
464 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  60.53 
 
 
465 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  60.48 
 
 
463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  59.47 
 
 
465 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  60.57 
 
 
464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  60.18 
 
 
464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  61.57 
 
 
472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  60.18 
 
 
466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  60.92 
 
 
471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  60.78 
 
 
464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  59.3 
 
 
467 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  60.83 
 
 
464 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  59.3 
 
 
467 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  59.61 
 
 
464 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  59.61 
 
 
463 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  60.83 
 
 
464 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  60.18 
 
 
465 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  59.3 
 
 
467 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  59.3 
 
 
467 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  60.83 
 
 
464 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  59.3 
 
 
467 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  59.43 
 
 
465 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  60.83 
 
 
464 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  60.83 
 
 
464 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  59.87 
 
 
465 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  59.96 
 
 
467 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  61 
 
 
464 aa  555  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  59.65 
 
 
465 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  60.26 
 
 
465 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  60.48 
 
 
464 aa  557  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  59.83 
 
 
463 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  58.52 
 
 
462 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  60.26 
 
 
463 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  59.96 
 
 
459 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  59.96 
 
 
464 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  59.96 
 
 
459 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  61.27 
 
 
466 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  59.3 
 
 
463 aa  554  1e-156  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  59.43 
 
 
465 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  59.96 
 
 
467 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  59.43 
 
 
470 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  58.3 
 
 
467 aa  551  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  59.96 
 
 
467 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  58.33 
 
 
461 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  58.95 
 
 
462 aa  548  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  61.71 
 
 
458 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  60.18 
 
 
467 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  58.08 
 
 
467 aa  549  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  58.33 
 
 
461 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  60.39 
 
 
466 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  59.96 
 
 
467 aa  547  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  58.95 
 
 
462 aa  548  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  58.95 
 
 
468 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  57.21 
 
 
468 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  59.96 
 
 
467 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  59.96 
 
 
467 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  59.96 
 
 
467 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  60.39 
 
 
464 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>