More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0308 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  98.17 
 
 		 109 aa  223  7e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  39.42 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  39.05 
 
 		 117 aa  93.2  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  37.14 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  38.1 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  35.24 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  36.19 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0781  30S ribosomal protein S6  42 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0213362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  31.43 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  31.78 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  32.38 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  32.38 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  31.43 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  29.91 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  28.97 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  30.48 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  30.53 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  27.36 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  26.42 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  27.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  27.62 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  29.03 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0062  ribosomal protein S6  31.07 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.613129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>