More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0135 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  91.84 
 
 
148 aa  286  7e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  63.89 
 
 
149 aa  201  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
158 aa  174  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  55.48 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  56.55 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  54.48 
 
 
159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  55.17 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  56.55 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  55.1 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
159 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
157 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
158 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
158 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  51.75 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  51.39 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  50 
 
 
160 aa  160  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
158 aa  159  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
155 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  50 
 
 
158 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  50 
 
 
156 aa  155  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
161 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
159 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  46.53 
 
 
155 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
165 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
158 aa  148  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
153 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
153 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  46.53 
 
 
160 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
152 aa  147  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  48.61 
 
 
159 aa  146  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  48.25 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  47.92 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
159 aa  143  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  46.72 
 
 
150 aa  142  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  50.77 
 
 
153 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  46.72 
 
 
150 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  46.53 
 
 
153 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  46.53 
 
 
160 aa  141  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  50 
 
 
158 aa  141  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
157 aa  139  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1861  SsrA-binding protein  48.98 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  52.08 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  44.76 
 
 
153 aa  138  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  47.59 
 
 
156 aa  138  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  50.69 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  45.45 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  46.1 
 
 
159 aa  137  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  45.45 
 
 
165 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  47.22 
 
 
150 aa  137  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  49.31 
 
 
157 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
157 aa  136  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  49.31 
 
 
157 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1901  SsrA-binding protein  46.94 
 
 
148 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  45.52 
 
 
157 aa  136  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  43.36 
 
 
160 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  42.86 
 
 
147 aa  136  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  43.42 
 
 
160 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  45.14 
 
 
150 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  44.06 
 
 
159 aa  135  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  46.53 
 
 
153 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  45.83 
 
 
172 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  47.59 
 
 
157 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1456  SsrA-binding protein  47.26 
 
 
150 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  47.52 
 
 
151 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  46.15 
 
 
168 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  43.75 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  46.1 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2019  SsrA-binding protein  46.26 
 
 
148 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6078  SsrA-binding protein  46.26 
 
 
148 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2032  SsrA-binding protein  46.26 
 
 
148 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.148914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  46.32 
 
 
149 aa  134  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1999  SsrA-binding protein  46.26 
 
 
148 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3370  SsrA-binding protein  46.98 
 
 
160 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0666937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  46.85 
 
 
159 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  46.1 
 
 
162 aa  134  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  48.28 
 
 
155 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  48.28 
 
 
155 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1277  SsrA-binding protein  46.58 
 
 
148 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.622701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  45.83 
 
 
148 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  43.92 
 
 
155 aa  133  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  44.76 
 
 
159 aa  133  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0771  SsrA-binding protein  42.47 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  47.1 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  44.22 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  45.52 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1365  SsrA-binding protein  46.53 
 
 
148 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269381  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  41.26 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  43.06 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>