43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0126 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  664    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  83.53 
 
 
334 aa  565  1e-160  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  35.05 
 
 
330 aa  220  3e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  24.58 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 
388 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  22.58 
 
 
334 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  21.26 
 
 
342 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  24.32 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  19.94 
 
 
337 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  24.6 
 
 
347 aa  102  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  18.84 
 
 
342 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  24.03 
 
 
347 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  20.51 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  20.13 
 
 
345 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  19.62 
 
 
342 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  20.77 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  25.97 
 
 
342 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  25.97 
 
 
342 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  23.75 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  23.08 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  23.76 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  22.53 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  24.86 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  20.63 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  21.69 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  26.98 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  23.76 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  19.76 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  22.65 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  21.2 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  20.82 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  19.05 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  18.65 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  19.81 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  22.73 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  19.69 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  19.77 
 
 
336 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  21.69 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  16.36 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>