More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0091 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  84.93 
 
 
418 aa  738    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
418 aa  858    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
416 aa  506  9.999999999999999e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
419 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 
421 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
423 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 
417 aa  438  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
423 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
418 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
417 aa  433  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
423 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 
417 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
423 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
417 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
415 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 
416 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
417 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  49.76 
 
 
488 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
417 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
418 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
417 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
417 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
424 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
417 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 
422 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
426 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
417 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
418 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
391 aa  402  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
416 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
418 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
420 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
414 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
409 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
412 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
412 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
408 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  44 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
435 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
424 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
424 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
421 aa  299  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
432 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
424 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
416 aa  286  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  39 
 
 
422 aa  282  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0169974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
431 aa  282  8.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
425 aa  280  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  37.68 
 
 
422 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
437 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
424 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
424 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
424 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
424 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
424 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
424 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
424 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
424 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3294  tyrosyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
424 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
447 aa  275  9e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  37.71 
 
 
424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0921  tyrosyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0622234  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
424 aa  272  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
424 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
424 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
424 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
424 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
424 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
425 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
420 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
420 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
424 aa  270  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119608  Tyrosyl-tRNA synthetase, probable  35.61 
 
 
484 aa  268  8.999999999999999e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
428 aa  269  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
418 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
425 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
418 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 
418 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>