More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0080 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 999 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 937 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  38.69 
 
 		 979 aa  676    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 979 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 932 aa  644    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  74.7 
 
 		 861 aa  904    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 992 aa  653    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 1016 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 937 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  39.56 
 
 		 978 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 1032 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  100 
 
 		 944 aa  1930    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 1021 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  38.99 
 
 		 978 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 976 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 928 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  36.92 
 
 		 1043 aa  635  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 937 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 1010 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  37.26 
 
 		 1025 aa  635  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 973 aa  626  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 1033 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 1014 aa  628  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 1000 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  35.43 
 
 		 1016 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  35.47 
 
 		 1047 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 1047 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 1047 aa  595  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  35.24 
 
 		 1024 aa  595  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 945 aa  579  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  34.49 
 
 		 1060 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  35.1 
 
 		 937 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 930 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  51.37 
 
 		 858 aa  565  1.0000000000000001e-159  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 934 aa  558  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 916 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  35.47 
 
 		 929 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 932 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  35.2 
 
 		 931 aa  535  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 932 aa  534  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  34.62 
 
 		 932 aa  535  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  35.6 
 
 		 930 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  34.04 
 
 		 949 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  34.02 
 
 		 928 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  34.36 
 
 		 933 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 928 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  33.95 
 
 		 918 aa  525  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  34.65 
 
 		 947 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  34.22 
 
 		 945 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  34.16 
 
 		 936 aa  512  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  33.51 
 
 		 907 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  33.81 
 
 		 956 aa  506  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  34.14 
 
 		 944 aa  509  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  35.8 
 
 		 930 aa  505  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  34.05 
 
 		 963 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  33.91 
 
 		 943 aa  505  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 957 aa  499  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  34.18 
 
 		 942 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  33.9 
 
 		 988 aa  501  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  33.78 
 
 		 944 aa  498  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 946 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  33.78 
 
 		 943 aa  485  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  33.06 
 
 		 924 aa  478  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  33.07 
 
 		 966 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  43.92 
 
 		 943 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  43.18 
 
 		 935 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  30.9 
 
 		 977 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  44.78 
 
 		 968 aa  442  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  42.23 
 
 		 1013 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  44.51 
 
 		 929 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  42.08 
 
 		 940 aa  438  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  43.86 
 
 		 1004 aa  432  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  42.02 
 
 		 915 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  31.26 
 
 		 879 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  43.21 
 
 		 924 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 879 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  31.48 
 
 		 982 aa  419  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  42.22 
 
 		 1020 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  41.46 
 
 		 941 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 917 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  31.26 
 
 		 879 aa  416  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  40.34 
 
 		 913 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  30.72 
 
 		 994 aa  412  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  28.97 
 
 		 1025 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 926 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  42.38 
 
 		 928 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  48.52 
 
 		 911 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 908 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  42.09 
 
 		 915 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  47.86 
 
 		 906 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  41.79 
 
 		 915 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  46.43 
 
 		 925 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  42.09 
 
 		 915 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  47.97 
 
 		 940 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  42.8 
 
 		 921 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 915 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 891 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  47.87 
 
 		 939 aa  392  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  48.08 
 
 		 951 aa  393  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  42.28 
 
 		 855 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>