263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0076 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  100 
 
 		 372 aa  749    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  85.98 
 
 		 372 aa  625  1e-178  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  47.92 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  30.91 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0003  recombination protein F  31.54 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  29.84 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.27 
 
 		 384 aa  199  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000323741  normal  0.930359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0004  recombination protein F  30.59 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0003  recombination protein F  30.59 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  29.14 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  30.51 
 
 		 379 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0003  recombination protein F  30.12 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0003  recombination protein F  28.61 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0003  recombination protein F  34.04 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  0.40226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0003  recombination protein F  27.82 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2800  recombination protein F  30.9 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2240  DNA replication and repair protein RecF  28.45 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2835  recombination protein F  32.25 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1707  recombination protein F  31.78 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.812314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0005  recombination protein F  29.89 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  30.6 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0004  recombination protein F  30.06 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  29.68 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1277  recombination protein F  30.56 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.19843e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0013  recombination protein F  30.77 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0003  recombination protein F  29.87 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3375  recombination protein F  32.25 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0003  recombination protein F  29.49 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0080717  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.55 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350342  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1344  recombination protein F  30.47 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.28 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.64703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.28 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.615543  normal  0.382944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.93 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  28.53 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4092  recombination protein F  29.95 
 
 		 374 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4412  recombination protein F  29.49 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.37 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  30.43 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3395  recombination protein F  29.22 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0158  recombination protein F  30.6 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43131  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0003  recombination protein F  29.74 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  26.3 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3146  DNA replication and repair protein RecF  28.99 
 
 		 403 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.522741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0199  putative DNA replication and repair protein RecF  30.43 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00154503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  26.04 
 
 		 373 aa  132  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.74 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  27.37 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  27.13 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  27.11 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  27.11 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  26.68 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  27.11 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  26.68 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.12 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.12 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  26.34 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  26.15 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  26.75 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  29.59 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  26.63 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  26.27 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.58 
 
 		 372 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  27.81 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.81 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  28.97 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  23.48 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.54 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.36 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  26 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.22 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  26.72 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  27.91 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  25.84 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.84 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  23.3 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  24.58 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  25.58 
 
 		 374 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  24.29 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  24.01 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  23.96 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  26.61 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  25.82 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  26.57 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0230  DNA replication and repair protein RecF  26.19 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000612971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  24.78 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  24.78 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  25.3 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.07 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.17 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  23.29 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0003  DNA replication and repair protein RecF  21.85 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  24.44 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  22.09 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  22.08 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0003  DNA replication and repair protein  21.89 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0109066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0003  recombination protein F  23.05 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000843052  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  24.93 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.49 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>