More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0073 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  78.07 
 
 
185 aa  310  1e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  48.62 
 
 
179 aa  174  9e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0392  peptide deformylase  46.7 
 
 
186 aa  169  2e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  44.86 
 
 
174 aa  165  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  44.32 
 
 
174 aa  164  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.48 
 
 
168 aa  157  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  44.02 
 
 
168 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  40 
 
 
171 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  42.93 
 
 
172 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  44.02 
 
 
168 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.54 
 
 
171 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  44.2 
 
 
177 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  41.94 
 
 
168 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  40.32 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  43.48 
 
 
168 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  41.94 
 
 
168 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.48 
 
 
178 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  42.47 
 
 
168 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  41.48 
 
 
176 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  40.54 
 
 
170 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  41.4 
 
 
193 aa  151  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  42.54 
 
 
175 aa  150  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40.76 
 
 
168 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  39.67 
 
 
172 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  43.01 
 
 
171 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  39.67 
 
 
168 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  39.67 
 
 
168 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  40.76 
 
 
169 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  43.01 
 
 
171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  43.65 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.33 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.33 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  39.67 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  41.4 
 
 
171 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  40.33 
 
 
175 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  41.4 
 
 
171 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  43.09 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.13 
 
 
168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  41.85 
 
 
169 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  41.62 
 
 
177 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  41.4 
 
 
171 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  41.85 
 
 
170 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  44.32 
 
 
179 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  41.85 
 
 
170 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  41.44 
 
 
180 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  43.48 
 
 
177 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  43.78 
 
 
167 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  42.31 
 
 
170 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  43.48 
 
 
171 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  44.32 
 
 
216 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  40.33 
 
 
184 aa  141  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  43.24 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  43.24 
 
 
167 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  38.92 
 
 
176 aa  141  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  42.7 
 
 
167 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  44.32 
 
 
179 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  44.32 
 
 
179 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  44.32 
 
 
179 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  42.7 
 
 
181 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  44.32 
 
 
167 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  39.78 
 
 
184 aa  140  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  44.32 
 
 
167 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  44.32 
 
 
167 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  42.7 
 
 
167 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  42.78 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  41.86 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  42.39 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.78 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  43.24 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  41.34 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  39.23 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  40.33 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  41.71 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  41.21 
 
 
177 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  39.89 
 
 
188 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  39.67 
 
 
169 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  41.85 
 
 
169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  41.3 
 
 
167 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  43.55 
 
 
167 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  39.78 
 
 
175 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  42.93 
 
 
167 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.38 
 
 
173 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  38.17 
 
 
169 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  38.17 
 
 
169 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  38.17 
 
 
169 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  38.17 
 
 
169 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  38.17 
 
 
169 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  43.11 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  44.32 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  39.13 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  41.44 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  40.22 
 
 
172 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  39.13 
 
 
170 aa  135  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  38.59 
 
 
169 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  40.22 
 
 
172 aa  134  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  38.59 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  38.59 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  38.59 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  39.13 
 
 
169 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>