More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0030 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
334 aa  681    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  84.64 
 
 
334 aa  590  1e-167  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  51.81 
 
 
338 aa  351  1e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  44.58 
 
 
348 aa  308  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0968  uroporphyrinogen decarboxylase  45.23 
 
 
324 aa  300  2e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  41.54 
 
 
355 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  43.17 
 
 
349 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  42.5 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  41.84 
 
 
342 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  41.16 
 
 
343 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  42.55 
 
 
350 aa  279  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  41.27 
 
 
338 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  41.07 
 
 
350 aa  278  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 
341 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  41.12 
 
 
341 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  40.5 
 
 
343 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  41.44 
 
 
348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  41.14 
 
 
348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  40.81 
 
 
341 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  41.43 
 
 
325 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  39.63 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
358 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  38.91 
 
 
344 aa  265  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 
341 aa  265  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  38.92 
 
 
360 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 
342 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  40.31 
 
 
325 aa  262  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  38.89 
 
 
344 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  38.15 
 
 
343 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 
340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  37.13 
 
 
343 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 
343 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  39.57 
 
 
345 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  38.63 
 
 
335 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  36.55 
 
 
343 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  38.44 
 
 
357 aa  255  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  37.77 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  36.23 
 
 
353 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1772  uroporphyrinogen decarboxylase  37.46 
 
 
360 aa  252  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.767605  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 
348 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  37.46 
 
 
361 aa  245  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4298  uroporphyrinogen decarboxylase  35.13 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0372721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  36.66 
 
 
370 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  41.41 
 
 
343 aa  241  9e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  37.28 
 
 
353 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1456  uroporphyrinogen decarboxylase  40.56 
 
 
343 aa  238  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  41.39 
 
 
340 aa  237  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  39.38 
 
 
340 aa  237  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  40.25 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  36.07 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  36.56 
 
 
346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  39.01 
 
 
340 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  39.01 
 
 
340 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  39.01 
 
 
340 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  36.86 
 
 
356 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0529  uroporphyrinogen decarboxylase  39.01 
 
 
340 aa  224  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2695  uroporphyrinogen decarboxylase  37.8 
 
 
342 aa  222  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0214736  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  38.92 
 
 
339 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  35.54 
 
 
354 aa  218  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  35.76 
 
 
357 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  34.23 
 
 
392 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  34.33 
 
 
375 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  34.33 
 
 
392 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  36.25 
 
 
354 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  35.89 
 
 
355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  36.61 
 
 
356 aa  215  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 
364 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  33.93 
 
 
364 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 
364 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  35.37 
 
 
354 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  38.3 
 
 
342 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 
364 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 
364 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 
364 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  36.34 
 
 
354 aa  215  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  34.83 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 
405 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  36.64 
 
 
354 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 
405 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  34.33 
 
 
392 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  34.03 
 
 
392 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  34.03 
 
 
392 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  36.34 
 
 
354 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  37.77 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  34.53 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  33.93 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  34.15 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  34.74 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  35.35 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  34.15 
 
 
354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  34.45 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  34.76 
 
 
354 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  34.66 
 
 
354 aa  212  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  36.63 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  37.09 
 
 
354 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  33.33 
 
 
354 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  36.06 
 
 
355 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  37.09 
 
 
354 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>