More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0029 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  82.85 
 
 
274 aa  457  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  55.68 
 
 
275 aa  314  9e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  46.62 
 
 
274 aa  267  1e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  46.81 
 
 
292 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  46.1 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  48.13 
 
 
279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  45.52 
 
 
292 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  46.84 
 
 
284 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  46.35 
 
 
285 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  47.12 
 
 
286 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  43.54 
 
 
293 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  43.68 
 
 
284 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  44.89 
 
 
284 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  46.01 
 
 
288 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  45.19 
 
 
285 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  44.64 
 
 
292 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  45 
 
 
291 aa  221  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  40.88 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  45.42 
 
 
287 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  43.57 
 
 
292 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  44.57 
 
 
285 aa  218  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  44.2 
 
 
285 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  44.2 
 
 
285 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  44.44 
 
 
268 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  43.77 
 
 
292 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  43.77 
 
 
439 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  46.49 
 
 
284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  48.13 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  45.19 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  44.81 
 
 
266 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  44.81 
 
 
266 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  43.23 
 
 
283 aa  208  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  42.09 
 
 
291 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  43.66 
 
 
273 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  47.25 
 
 
286 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0725  cytochrome c oxidase subunit III  46.86 
 
 
287 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0613182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  44.98 
 
 
284 aa  201  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  44.98 
 
 
284 aa  201  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3880  cytochrome c oxidase, subunit III  40.45 
 
 
289 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.351442  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  41.39 
 
 
270 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  44.24 
 
 
284 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  44.24 
 
 
284 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  42.22 
 
 
271 aa  188  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  38.33 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  37.37 
 
 
293 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  35.69 
 
 
284 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  34.4 
 
 
291 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  35.74 
 
 
286 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  33 
 
 
297 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  34.26 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  35 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  35.69 
 
 
283 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  33.68 
 
 
293 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  35.52 
 
 
293 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  36.75 
 
 
293 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  35.34 
 
 
293 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  35.97 
 
 
290 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  34.38 
 
 
293 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  35.02 
 
 
286 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  34.97 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  34.28 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  32.89 
 
 
291 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  32.07 
 
 
294 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  34.63 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  35.61 
 
 
286 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  33.22 
 
 
294 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  31.88 
 
 
291 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  34.63 
 
 
293 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  35.97 
 
 
286 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  35.97 
 
 
286 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  33.56 
 
 
293 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  34.48 
 
 
291 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  34.14 
 
 
291 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  35.25 
 
 
286 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  34.14 
 
 
291 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  36.76 
 
 
284 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  34.14 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  34.66 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  33.56 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  33.57 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  35.25 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  35.25 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  31.83 
 
 
289 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  35.25 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  35.25 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  35.25 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  35.25 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  36.33 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  33.22 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  33.33 
 
 
296 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  31.83 
 
 
289 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  35.38 
 
 
285 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  35.38 
 
 
285 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  35.38 
 
 
285 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  35.25 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  34.14 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  36.52 
 
 
294 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  33.22 
 
 
295 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>