More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0004 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0004  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0932  50S ribosomal protein L19  89.6 
 
 		 125 aa  231  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.123907  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1021  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  49.18 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  47.58 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  47.58 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  46.77 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  48 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  47.54 
 
 		 163 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  51.26 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  51.85 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  47.46 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 184 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  121  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  47.11 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 117 aa  120  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  51.85 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  45.76 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  48.7 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  48.7 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1162  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000263892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 180 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1257  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000965232  hitchhiker  0.0000525185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  45.61 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  47.58 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1052  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000268898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  49.14 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  46.9 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  45.76 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1066  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000285851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  45.6 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  52.43 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  45.83 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  45.38 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  45.38 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  45.69 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  46.28 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  45.76 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  53.27 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  44.17 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  49.57 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  46.96 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  55.1 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  46.96 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  47.86 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  43.7 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  44.92 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  46.55 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  47.01 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  47.01 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>