More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0001 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  87.86 
 
 
283 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  56.43 
 
 
283 aa  310  1e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  40.43 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  42.71 
 
 
299 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  42.27 
 
 
298 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  35.25 
 
 
319 aa  229  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  39.93 
 
 
296 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  41.76 
 
 
326 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  40 
 
 
293 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  40 
 
 
293 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  39.02 
 
 
296 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  40.28 
 
 
288 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  41.32 
 
 
292 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  39.72 
 
 
293 aa  225  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  39.79 
 
 
293 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  39.86 
 
 
294 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  39.59 
 
 
293 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  37.98 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  40.62 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  45.42 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  38.03 
 
 
296 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  39.44 
 
 
294 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  40.07 
 
 
296 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  44.89 
 
 
289 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  38.49 
 
 
296 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  42.66 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  38.89 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  39.72 
 
 
300 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  39.58 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  39.07 
 
 
292 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  40.42 
 
 
298 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  40.74 
 
 
303 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  39.29 
 
 
286 aa  210  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  42.31 
 
 
292 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  36.21 
 
 
297 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  38.38 
 
 
284 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  39.73 
 
 
303 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  38.06 
 
 
301 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.46 
 
 
289 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.9 
 
 
286 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  39.66 
 
 
305 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  39.13 
 
 
274 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  38.38 
 
 
289 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  37.72 
 
 
297 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  37.98 
 
 
305 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  36.71 
 
 
297 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  40 
 
 
279 aa  204  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  34.12 
 
 
315 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  38.91 
 
 
306 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  42.51 
 
 
281 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  41.5 
 
 
295 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  39.66 
 
 
290 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  39.66 
 
 
288 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  35.93 
 
 
321 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  39.15 
 
 
282 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  40.07 
 
 
294 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  39.64 
 
 
279 aa  202  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  38.57 
 
 
293 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  38.43 
 
 
286 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.34 
 
 
284 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  36.71 
 
 
280 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  35.74 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  38.41 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  38.57 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  38.43 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  42.76 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.34 
 
 
284 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  39.52 
 
 
294 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  38.91 
 
 
294 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  38.52 
 
 
295 aa  198  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.03 
 
 
294 aa  198  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  37.55 
 
 
309 aa  198  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  39.79 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  36.4 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  38.62 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  36.97 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  36.97 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  36.33 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  36.23 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  36.97 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  37.91 
 
 
306 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  37.68 
 
 
290 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.61 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  38.25 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  36.59 
 
 
310 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  37.68 
 
 
306 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  34.6 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  40.61 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  38.28 
 
 
323 aa  194  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  36.52 
 
 
307 aa  195  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  37.54 
 
 
306 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  38.63 
 
 
285 aa  195  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  40.08 
 
 
263 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  35.23 
 
 
303 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  37.97 
 
 
309 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  36.12 
 
 
314 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  37.54 
 
 
290 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  34.6 
 
 
303 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>