24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0092 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0092  CopG family protein  100 
 
 		 94 aa  190  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0262945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0022  CopG family protein  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6450  CopG family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 93 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158963  normal  0.302139 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5345  transcriptional regulator, CopG family  73.81 
 
 		 86 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.459849 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5961  CopG family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 86 aa  133  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5065  transcriptional regulator, CopG family  72.62 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1682  transcriptional regulator, CopG family  68.24 
 
 		 89 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1736  transcriptional regulator, CopG family  72.84 
 
 		 87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.814149  normal  0.384272 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4448  transcriptional regulator, CopG family  72.84 
 
 		 87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00107538  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5045  transcriptional regulator, CopG family  72.84 
 
 		 87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4338  transcriptional regulator, CopG family  72.84 
 
 		 87 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34669  normal  0.37145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0698  CopG family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 89 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0592094  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2208  CopG family transcriptional regulator  69.05 
 
 		 90 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.901295  normal  0.042561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0036  transcriptional regulator, CopG family  50.57 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0479  CopG family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4874  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62267  hitchhiker  0.00867489 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4792  transcriptional regulator, CopG family  35.9 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3045  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2781  hypothetical protein  40.54 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587887 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0584  hypothetical protein  35.71 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00104491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1249  transcriptional regulator-like protein  28.41 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000553131  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0417  hypothetical protein  32.39 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0408  hypothetical protein  32.39 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1125  CopG family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 118 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000121555  unclonable  0.00000692901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>