More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0081 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  100 
 
 
286 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  99.65 
 
 
286 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  32.18 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  28.47 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
297 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  27.78 
 
 
295 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  29.01 
 
 
467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  28.06 
 
 
309 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  29.47 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  30.07 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  28.87 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  29.82 
 
 
313 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  29.01 
 
 
321 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  28.03 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  29.3 
 
 
297 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  27.49 
 
 
306 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
314 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  26.64 
 
 
300 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  28.99 
 
 
298 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
312 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  29.73 
 
 
317 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
295 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  30.32 
 
 
308 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  28.63 
 
 
292 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
295 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
295 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
316 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  27.05 
 
 
305 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.32 
 
 
301 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  27.35 
 
 
315 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  39.5 
 
 
309 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.07 
 
 
318 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  27.84 
 
 
295 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  27.31 
 
 
299 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  26.67 
 
 
304 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  26.62 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  38.02 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  23.83 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  23.51 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  26.52 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
313 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
313 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  23.27 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  23.64 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  23.64 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  33.59 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  24 
 
 
310 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  24 
 
 
310 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  24 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  24 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  22.59 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  23.64 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  23.95 
 
 
351 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  23.27 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  24.15 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001536  hydrolases of the alpha/beta superfamily  24.29 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  23.77 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2929  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  35.38 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  23.39 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  32.33 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  24.34 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  22.84 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  25.75 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  24.64 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  24.65 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  23.91 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  22.47 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  24.3 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  30.47 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  29.76 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  29.6 
 
 
866 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  23.96 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  34.29 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  23.57 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  23.57 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  33.98 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  32 
 
 
876 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.27 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  25.57 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  22.11 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  22.55 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  22.3 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  24 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  25.63 
 
 
517 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0717  hypothetical protein  23.33 
 
 
378 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  24.03 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  30.43 
 
 
336 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  26.11 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  25.27 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  22.52 
 
 
356 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  24.34 
 
 
320 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  23.71 
 
 
368 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  23.69 
 
 
465 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>