More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5792 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  86.49 
 
 		 185 aa  324  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  66.14 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  67.38 
 
 		 192 aa  238  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  52.78 
 
 		 191 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  48.33 
 
 		 193 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  50 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 196 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  47.06 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  47.06 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  48.89 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  47.03 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  47.03 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  47.22 
 
 		 191 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  48.89 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  47.78 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  42.54 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  46.52 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  41.99 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  41.99 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  41.99 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  41.99 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  41.99 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  46.11 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  41.99 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  41.99 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  44.5 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  44.57 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  41.8 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  40.43 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  42.86 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  42.71 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  35.71 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.31 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  35.48 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  38.22 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  34.95 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  40.56 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  35.9 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  42 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  41.85 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  41.85 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  41.85 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  40.76 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  33.69 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  38.42 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  40.84 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  38.92 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.42 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  40.11 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.36 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  36.36 
 
 		 186 aa  102  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  32.98 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.96 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  33.87 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  39.13 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  39.13 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  32.64 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.63 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.63 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.63 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  35.91 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  35.39 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 184 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  41.3 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.77 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.04 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  32.8 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 		 180 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.51 
 
 		 192 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  40.86 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.6 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 		 307 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  37.1 
 
 		 307 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  37.91 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.91 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  34.38 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  37.91 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.46 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  33.67 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  37.43 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  37.43 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.26 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  41.33 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>