More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5071 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5071  secretion system apparatus protein SsaU  100 
 
 		 345 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796147  normal  0.0581283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1977  secretion system apparatus protein SsaU  41.16 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2281  secretion system apparatus protein SsaU  41.16 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3811  secretion system apparatus protein SsaU  40.99 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3926  secretion system apparatus protein SsaU  40.99 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3899  secretion system apparatus protein SsaU  40.99 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1518  secretion system apparatus protein SsaU  39.42 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00925486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1752  secretion system apparatus protein SsaU  39.13 
 
 		 352 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1555  secretion system apparatus protein SsaU  38.84 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1532  secretion system apparatus protein SsaU  38.84 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.371934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1921  secretion system apparatus protein SsaU  38.84 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01723  Type III secretory pathway, component EscU  35.76 
 
 		 349 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003359  type III secretion inner membrane protein HrpY  35.99 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0048  type III secretion appartus protein YscU  35.42 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42660  translocation protein in type III secretion  35.48 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3011  YscD family type III secretion protein  31.61 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2412  type III secretion protein, YscU/HrpY family  30.9 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2393  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.28 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1882  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.48 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0049  YscU/HrpY family type III secretion protein  32.49 
 
 		 359 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0069  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.03 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0868  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  30.9 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0453  type III secretion system protein HrcU  31.46 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.0822049 
 
 
-
 
NC_002620  TC0366  type III secretion system protein  35.06 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2215  type III secretion protein, YscU/HrpY family  31.11 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1412  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.36 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342211  normal  0.890154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0484  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.78 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0127914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1409  flagellar biosynthetic protein FlhB  27.89 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1930  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.2 
 
 		 363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.922236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.06 
 
 		 360 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1205  type III secretion protein HrcU  32.67 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322672  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4135  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.25 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0846766  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0380  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.66 
 
 		 362 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.441846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1674  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.89 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1556  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1545  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1715  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.97 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0332  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.14 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1766  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3609  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1129  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.13 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0658  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.18 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.622115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0703  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.75 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16690  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.11 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0011  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.23 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1735  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.736219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1844  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.97 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0972714  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0357  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.36 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1592  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.94 
 
 		 348 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1392  type III secretion protein HrcU  32.95 
 
 		 359 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1384  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.65 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.226295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  31.29 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000937461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2154  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.47 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1330  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.35 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5857  type III secretion system protein HrcU  31.21 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0342  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.15 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00837822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0743  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.95 
 
 		 381 aa  156  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5640  type III secretion system protein HrcU  31.21 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0018  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.99 
 
 		 374 aa  156  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000395256  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1623  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.36 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1631  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.97 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0242  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.38 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.33455  normal  0.0187302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2575  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.26 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011127 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03402  type III secretion system protein HrcU  32.95 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0981  flagellar biosynthetic protein FlhB  30.43 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0623  flagellar biosynthesis protein FlhB  32.38 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3009  surface presentation of antigens protein SpaS  30.25 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3077  surface presentation of antigens protein SpaS  30.53 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3197  surface presentation of antigens protein SpaS  30.53 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3092  surface presentation of antigens protein SpaS  30.53 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000792926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3040  surface presentation of antigens protein SpaS  30.53 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110418 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0054  flagellar biosynthesis protein FlhB  30.62 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5932  type III secretion system protein HrcU  30.55 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.897512  normal  0.0426598 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4137  surface presentation of antigens protein SpaS  31.99 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4406  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.65 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1904  type III secretion system protein HrcU  29.97 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0427  type III secretion system protein HrcU  29.97 
 
 		 352 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0498216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1397  flagellar biosynthetic protein FlhB  32.37 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1374  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.31 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1996  type III secretion system protein HrcU  29.68 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3217  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.2 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3431  flagellar biosynthetic protein FlhB  28.86 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0703  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.69 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.246065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1137  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.33 
 
 		 359 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0341  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.94 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00619914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3750  type III secretion exporter  29.89 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5440  type III secretion exporter  30.03 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368429  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0309  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.36 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4222  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.93 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2955  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.17 
 
 		 363 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.111273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1195  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.03 
 
 		 377 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2808  flagellar biosynthesis protein FlhB  27.99 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2030  flagellar biosynthetic protein FlhB  29.79 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.9056  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3055  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.74 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0721  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.49 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.366885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2563  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.33 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.757068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3215  flagellar biosynthesis protein FlhB  29.36 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3256  flagellar biosynthesis protein FlhB  31.25 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1339  flagellar biosynthesis protein FlhB  28.16 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>