203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5029 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  88.6 
 
 
772 aa  1467    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  98.45 
 
 
772 aa  1594    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  48.24 
 
 
780 aa  696    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  96.24 
 
 
763 aa  1546    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  98.19 
 
 
772 aa  1591    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  98.06 
 
 
772 aa  1590    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  56.19 
 
 
779 aa  892    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  98.19 
 
 
772 aa  1591    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  53.14 
 
 
775 aa  841    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  54.53 
 
 
771 aa  892    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  88.6 
 
 
772 aa  1463    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  52.49 
 
 
804 aa  814    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  88.86 
 
 
772 aa  1468    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  53.69 
 
 
770 aa  867    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  54.95 
 
 
760 aa  868    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  98.06 
 
 
772 aa  1590    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  50.46 
 
 
764 aa  824    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  47.33 
 
 
712 aa  678    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  88.99 
 
 
772 aa  1471    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  88.6 
 
 
772 aa  1466    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  56.23 
 
 
775 aa  881    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  53.18 
 
 
777 aa  860    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  45.93 
 
 
823 aa  686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  53.19 
 
 
681 aa  755    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  54.63 
 
 
766 aa  845    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  83.94 
 
 
772 aa  1397    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  52.7 
 
 
772 aa  867    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  50.2 
 
 
764 aa  818    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  51.94 
 
 
775 aa  870    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  54.3 
 
 
749 aa  848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  52.6 
 
 
763 aa  781    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 
772 aa  1617    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  97.93 
 
 
772 aa  1589    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  97.93 
 
 
772 aa  1589    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  56.81 
 
 
774 aa  912    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  51.03 
 
 
780 aa  838    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  51.8 
 
 
760 aa  782    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  40.5 
 
 
608 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  38.47 
 
 
760 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  36.02 
 
 
765 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  38.93 
 
 
765 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  38.94 
 
 
794 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  38.2 
 
 
795 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  38.01 
 
 
757 aa  376  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  34.3 
 
 
799 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 
695 aa  330  7e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 
778 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  29.78 
 
 
752 aa  303  7.000000000000001e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 
784 aa  293  6e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  29.25 
 
 
755 aa  261  3e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  28.27 
 
 
768 aa  258  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  29.01 
 
 
770 aa  258  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.41 
 
 
779 aa  256  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  28.55 
 
 
779 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  26.28 
 
 
792 aa  245  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  27.02 
 
 
828 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  27.27 
 
 
836 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  29.13 
 
 
803 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  26.37 
 
 
801 aa  230  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.97 
 
 
799 aa  229  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.06 
 
 
821 aa  227  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  28.41 
 
 
797 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  24.36 
 
 
776 aa  216  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.52 
 
 
785 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.34 
 
 
794 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.86 
 
 
798 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  25.69 
 
 
746 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  26.59 
 
 
779 aa  208  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 
813 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  25.63 
 
 
752 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  23.5 
 
 
777 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  26.48 
 
 
743 aa  197  9e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  25.56 
 
 
700 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  24.02 
 
 
839 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  26.5 
 
 
806 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  27.16 
 
 
695 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  27.16 
 
 
806 aa  190  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 
806 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 
806 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  27.29 
 
 
806 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  25.43 
 
 
679 aa  188  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  26.63 
 
 
803 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  25.37 
 
 
828 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 
806 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  27.68 
 
 
803 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  25.03 
 
 
806 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  25.04 
 
 
783 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  27.9 
 
 
821 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.26 
 
 
803 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  25.13 
 
 
845 aa  181  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  22.7 
 
 
728 aa  180  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00280  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03140)  26.69 
 
 
661 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0244988 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0520  alpha-glucosidase  26.61 
 
 
668 aa  180  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.284712  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  26.23 
 
 
815 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  25.65 
 
 
816 aa  179  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  25.18 
 
 
806 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  24.61 
 
 
1024 aa  177  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  27.52 
 
 
840 aa  177  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  24.47 
 
 
679 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07120  conserved hypothetical protein  24.24 
 
 
699 aa  177  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.845548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>