250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4951 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03437  putative permease  99.36 
 
 
466 aa  936    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  100 
 
 
466 aa  944    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  99.36 
 
 
466 aa  936    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  98.5 
 
 
466 aa  927    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  43.65 
 
 
466 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  40.53 
 
 
465 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  41.93 
 
 
468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  41.93 
 
 
468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  41.93 
 
 
468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  41.93 
 
 
468 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  41.93 
 
 
468 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  39.19 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.46 
 
 
478 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.5 
 
 
477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  36.24 
 
 
478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  37.89 
 
 
443 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.89 
 
 
442 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.17 
 
 
442 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.29 
 
 
444 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.29 
 
 
444 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.06 
 
 
444 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.06 
 
 
444 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.06 
 
 
444 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.6 
 
 
441 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.65 
 
 
444 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  38.15 
 
 
441 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  37.92 
 
 
442 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  38.48 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  38.48 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  38.48 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.36 
 
 
441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  38.48 
 
 
460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  38.84 
 
 
464 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.98 
 
 
442 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  37.27 
 
 
442 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  37.42 
 
 
460 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  37.31 
 
 
479 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  37.42 
 
 
460 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  37.31 
 
 
479 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  37.42 
 
 
460 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  37.36 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  37.09 
 
 
479 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  37.19 
 
 
460 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  37.19 
 
 
460 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.84 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.83 
 
 
481 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.68 
 
 
481 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.16 
 
 
471 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.45 
 
 
481 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.97 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  35.74 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.97 
 
 
463 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  35.19 
 
 
442 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  34.61 
 
 
467 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.13 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  32.74 
 
 
459 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  28.98 
 
 
461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.08 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  32.33 
 
 
447 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  32.98 
 
 
462 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.62 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3869  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.15 
 
 
486 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.35 
 
 
465 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.77 
 
 
461 aa  210  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.8 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03868  transport protein  28.1 
 
 
514 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.07 
 
 
497 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.39 
 
 
465 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.58 
 
 
471 aa  190  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  27.89 
 
 
457 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3707  sugar:cation symporter family protein  26.72 
 
 
511 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.75 
 
 
457 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.02 
 
 
513 aa  170  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  32.42 
 
 
538 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  29.74 
 
 
462 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  29.83 
 
 
481 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  29.83 
 
 
473 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  29.83 
 
 
481 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  29.83 
 
 
473 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  29.83 
 
 
473 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  30 
 
 
469 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  28.88 
 
 
465 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  30 
 
 
469 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30 
 
 
469 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  28.22 
 
 
457 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  28.22 
 
 
457 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  28.22 
 
 
471 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  28.22 
 
 
471 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.24 
 
 
468 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.43 
 
 
447 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  26.41 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  26.46 
 
 
454 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  38.42 
 
 
522 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.83 
 
 
474 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.83 
 
 
474 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  31.37 
 
 
437 aa  144  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.83 
 
 
474 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  27.41 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.13 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  27.41 
 
 
476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>