81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4506 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  100 
 
 
321 aa  637  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.36684e-09  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  99.38 
 
 
321 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  99.38 
 
 
321 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  99.38 
 
 
321 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.21429e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  99.38 
 
 
321 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  99.38 
 
 
321 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.96501e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  99.38 
 
 
321 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  99.38 
 
 
321 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.15039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  98.44 
 
 
321 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.41e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  92.83 
 
 
321 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  92.83 
 
 
321 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.43428e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  92.83 
 
 
321 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  92.83 
 
 
321 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  89.41 
 
 
321 aa  580  1e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  6.93359e-07  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  78.88 
 
 
328 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.95591e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  78.88 
 
 
328 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  73.75 
 
 
334 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.64528e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  78.88 
 
 
312 aa  471  1e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.42668e-11  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  75 
 
 
320 aa  464  1e-130  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75 
 
 
320 aa  467  1e-130  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  8.27739e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  73.55 
 
 
314 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.92809e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.1 
 
 
306 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  45.21 
 
 
306 aa  253  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  43.81 
 
 
320 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  41.81 
 
 
319 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  40.79 
 
 
319 aa  213  5e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  43.09 
 
 
328 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  43.39 
 
 
324 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  43.39 
 
 
324 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  41.48 
 
 
320 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  39.19 
 
 
311 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  41.14 
 
 
320 aa  189  6e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  36.24 
 
 
305 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  35.64 
 
 
312 aa  163  4e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  31.65 
 
 
329 aa  130  2e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  31.77 
 
 
329 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  31.31 
 
 
329 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  32 
 
 
349 aa  128  1e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  30.3 
 
 
324 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  30.3 
 
 
324 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 
324 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  31.1 
 
 
324 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  30.2 
 
 
321 aa  121  1e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  30.1 
 
 
339 aa  120  4e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  30.2 
 
 
325 aa  116  4e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  30.41 
 
 
320 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  27.84 
 
 
322 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  29.29 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.82 
 
 
299 aa  57.8  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 
285 aa  57.4  3e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.7 
 
 
294 aa  56.2  7e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.7 
 
 
294 aa  55.1  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 
325 aa  54.3  3e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.18 
 
 
294 aa  52.4  1e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  22.61 
 
 
305 aa  52.4  1e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.09 
 
 
294 aa  51.2  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  26.7 
 
 
294 aa  51.6  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 
301 aa  50.8  3e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.57317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 
315 aa  50.4  4e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  25.13 
 
 
294 aa  50.1  5e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  26.18 
 
 
295 aa  50.1  5e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  25.13 
 
 
294 aa  50.1  5e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  25.13 
 
 
294 aa  50.1  5e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  25.13 
 
 
294 aa  49.7  6e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.24016e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.19 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 
295 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.07 
 
 
308 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  26.95 
 
 
306 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
294 aa  45.8  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.33 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  30.36 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.22 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  25.82 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  25.62 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  29.82 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  24.87 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>