More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3766 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  99.65 
 
 
293 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  584  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  99.65 
 
 
293 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  99.65 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  99.65 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  98.94 
 
 
284 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  98.94 
 
 
284 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  98.24 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  98.24 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  67.12 
 
 
292 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  67.12 
 
 
292 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  67.12 
 
 
292 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  66.78 
 
 
292 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  61.3 
 
 
270 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  34.72 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  32.1 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  31.92 
 
 
298 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.68 
 
 
297 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  32.64 
 
 
296 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  31.43 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  32.08 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30 
 
 
286 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  29.64 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  32.07 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  29.62 
 
 
307 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  31.65 
 
 
301 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  30.13 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  28.46 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  29.36 
 
 
295 aa  118  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  30.13 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  30.99 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  30.96 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  30.45 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  32.05 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  27.85 
 
 
271 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  31.12 
 
 
290 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  31.02 
 
 
297 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  30.57 
 
 
276 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  30.64 
 
 
307 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  28.33 
 
 
266 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  26.95 
 
 
277 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  25.51 
 
 
303 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  30.21 
 
 
307 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  30.88 
 
 
314 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  28.16 
 
 
306 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  30.88 
 
 
292 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  28.99 
 
 
296 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
305 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  27.57 
 
 
282 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  28.38 
 
 
314 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  31.11 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  28.77 
 
 
274 aa  99  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  28.05 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  30.52 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  32.45 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  30.08 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  31.01 
 
 
311 aa  95.5  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  26.38 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  30.41 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  31.76 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  30.63 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  31.02 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  29.44 
 
 
336 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  25.79 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  27.95 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30 
 
 
294 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  26.61 
 
 
315 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  30.84 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  28.07 
 
 
324 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  29.3 
 
 
278 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  28.96 
 
 
295 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  29.56 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  29.96 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  31.77 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  27.85 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  28.68 
 
 
293 aa  82  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  26.49 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  27.62 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  26.46 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  31.18 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  31.18 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  31.18 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  26.07 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  29.22 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  27.57 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  27.88 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  29.36 
 
 
294 aa  79  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  25.86 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30.27 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  26.07 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  29.91 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5113  predicted protein  27.46 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00868611  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  27.98 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.11 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  25.13 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  27.93 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>