58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3556 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  45.64 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  54.35 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  33.48 
 
 		 421 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  32.42 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  36.59 
 
 		 331 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  31.22 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  24.07 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  27.01 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  28.64 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  36.26 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  32.98 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  32.98 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  24.5 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  31.91 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  30 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  32.26 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  32.26 
 
 		 210 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  32.22 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  34.83 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  32.69 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  31.71 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  27.44 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  27.7 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.71 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  22.9 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  26.52 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  23.71 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  26.71 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  26.4 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  31.87 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  28.11 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  23.71 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  24.86 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  25.93 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.21 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  22.99 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  26.19 
 
 		 138 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  29.21 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  22.73 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  21.78 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  26.43 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  25.68 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  33.71 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  35.53 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  32.1 
 
 		 140 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  34.88 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  25.41 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  32.98 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0048  hypothetical protein  24.14 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.121962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  27.72 
 
 		 265 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  23.86 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>