138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3440 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  3.13481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  5.98412e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.04392e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.10353e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.40004e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  3.89117e-07  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.41815e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.72838e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  85.16 
 
 
183 aa  323  8e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  85.16 
 
 
183 aa  323  8e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  85.16 
 
 
183 aa  323  8e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  85.16 
 
 
183 aa  323  8e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  85.16 
 
 
183 aa  323  8e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  8.36998e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  82.97 
 
 
183 aa  317  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  4.08209e-05  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  72.53 
 
 
183 aa  271  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  3.35097e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  71.43 
 
 
183 aa  269  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.86616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  70.33 
 
 
183 aa  268  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.13864e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  69.23 
 
 
183 aa  262  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  69.23 
 
 
183 aa  261  5e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  7e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.90734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  7e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.66311e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  68.68 
 
 
183 aa  260  7e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  4.39444e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  58.01 
 
 
185 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  59.88 
 
 
183 aa  218  4e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  54.64 
 
 
187 aa  211  4e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  53.85 
 
 
181 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  57.39 
 
 
189 aa  201  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  51.1 
 
 
181 aa  196  1e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  55.37 
 
 
193 aa  194  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  47.28 
 
 
186 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  42.86 
 
 
187 aa  165  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.97737e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  44.26 
 
 
188 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  47.19 
 
 
182 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.37 
 
 
182 aa  151  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  48.78 
 
 
174 aa  151  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  48.15 
 
 
178 aa  147  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.97 
 
 
186 aa  147  1e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  40 
 
 
188 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  40.48 
 
 
187 aa  126  1e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  39.77 
 
 
185 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  34.78 
 
 
181 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  38.69 
 
 
187 aa  118  5e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.03 
 
 
180 aa  116  2e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  36.6 
 
 
184 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  39.49 
 
 
188 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.34313e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.51 
 
 
186 aa  101  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.47 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  32.6 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  32.45 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  29.17 
 
 
156 aa  63.9  1e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  30.36 
 
 
157 aa  62  5e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.25 
 
 
156 aa  59.7  3e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  5.90014e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.2 
 
 
223 aa  58.9  4e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  34.11 
 
 
168 aa  58.2  6e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.8023e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.14 
 
 
232 aa  57.8  8e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.63 
 
 
156 aa  57.8  9e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  7.39352e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.14 
 
 
232 aa  57.8  9e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  31.82 
 
 
256 aa  57.8  9e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.5 
 
 
223 aa  56.2  2e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.58 
 
 
162 aa  57  2e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  26.18 
 
 
219 aa  57  2e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.97 
 
 
170 aa  57  2e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.21 
 
 
222 aa  55.8  3e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.32 
 
 
178 aa  56.2  3e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.59 
 
 
222 aa  55.1  5e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.99 
 
 
154 aa  54.7  6e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.38 
 
 
169 aa  54.3  9e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  25.45 
 
 
238 aa  53.9  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.98 
 
 
159 aa  53.5  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.34 
 
 
163 aa  53.1  2e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.18 
 
 
235 aa  53.1  2e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  30.86 
 
 
157 aa  53.5  2e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.9 
 
 
166 aa  53.1  2e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  24.88 
 
 
243 aa  52.8  3e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  29.44 
 
 
240 aa  52.4  4e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  26.63 
 
 
233 aa  52  5e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.36 
 
 
219 aa  51.2  9e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  29.59 
 
 
156 aa  50.8  9e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  31.31 
 
 
167 aa  50.8  1e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  28.08 
 
 
281 aa  50.4  1e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  26.17 
 
 
259 aa  50.1  2e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.57 
 
 
243 aa  50.1  2e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  27.86 
 
 
222 aa  49.7  2e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  31.53 
 
 
160 aa  48.9  4e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  36.61 
 
 
181 aa  48.9  4e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.67 
 
 
164 aa  48.5  5e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  30.77 
 
 
173 aa  48.1  6e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  27.81 
 
 
161 aa  48.5  6e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  27.65 
 
 
297 aa  48.1  7e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.02 
 
 
254 aa  47.8  8e-05  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0382  metallophosphoesterase  27.65 
 
 
259 aa  47.8  9e-05  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  23.5 
 
 
681 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  24 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.66 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.26 
 
 
156 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.93 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  24.61 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  23.74 
 
 
254 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>