26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3222 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3222  endodeoxyribonuclease RUS  100 
 
 		 120 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298592  hitchhiker  0.00412793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1609  endodeoxyribonuclease RUS  95 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00500  endonuclease RUS  94.17 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.377255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0821  endodeoxyribonuclease RUS  95 
 
 		 120 aa  240  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00505  hypothetical protein  95.65 
 
 		 115 aa  234  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.320878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0300  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  44.54 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1175  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  40.71 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000177122  hitchhiker  0.000000000000201219 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  41.59 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00142112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1435  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA-like protein  41.59 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2799  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  41.07 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.629369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2267  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA homolog  39.82 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565025  hitchhiker  0.0000000001404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1260  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  38.26 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000987444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1441  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.91 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1764  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  39.13 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387819  hitchhiker  0.00606421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1845  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  41.28 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000255271  hitchhiker  0.00000000107565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3154  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  41.28 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000295998  hitchhiker  0.0000000000179448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1159  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  39.83 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2281  holiday-junction resolvase  41.18 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.328249  hitchhiker  1.35608e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4449  bacteriophage V crossover junction endodeoxyribonuclease  38.98 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00181578  unclonable  0.00000000115544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2155  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  38.98 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259574  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3595  endodeoxyribonuclease RusA  37.5 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1523  crossover junction endodeoxyribonuclease RusA  40.28 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1129  endodeoxyribonuclease RusA  33.66 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0625  Rus  58.54 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272952  decreased coverage  0.000000305727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  28.04 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  29.81 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>