More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2942 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  100 
 
 		 392 aa  818    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  60.71 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  60.97 
 
 		 393 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  56.78 
 
 		 389 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  40.98 
 
 		 403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  40.83 
 
 		 390 aa  278  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 401 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  33.92 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  35.82 
 
 		 419 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  32.65 
 
 		 409 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  29.85 
 
 		 409 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  30.51 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  32.5 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  32.43 
 
 		 407 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  29.46 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  29.56 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.91 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  28.35 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0948  putative integrase  30.41 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  27.53 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.7 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  29.19 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  28.89 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.27 
 
 		 402 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.1 
 
 		 433 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  26.8 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  28.22 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.15 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  27.32 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  27.41 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  28.03 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  28.57 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.51 
 
 		 399 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  27.89 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.9 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  28.21 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  28.64 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.9 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  26.7 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  28.39 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  26.21 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.65 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  27.46 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  26.1 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  27.76 
 
 		 434 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  26.65 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  27.39 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  27.16 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.23 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  26.49 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  26.2 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  26.2 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  27.88 
 
 		 515 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.96 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  24.35 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  28.26 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  28.16 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  28.88 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  28.16 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  26.56 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  25.38 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  26.56 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  27.21 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  26.09 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.97 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  27.95 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  27.45 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  26.04 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  26.99 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  24.93 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.11 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  25.99 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  28.05 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1719  phage integrase family protein  32.54 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 418 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  25.9 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.12 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  25.19 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  27.01 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  28.46 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  25.99 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  25.45 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  24.74 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  24.93 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 413 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  23.51 
 
 		 419 aa  96.3  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  26.37 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 419 aa  96.3  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  24.22 
 
 		 422 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  24.74 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>